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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000775`

染色体: Chr08 坐标: 5707148-5711318 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000775`
名称	SmilChr08G000775
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	5707148 - 5711318 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000356`
GeneID	`131000356`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000356`
原始查询	`LOC131000356`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
Arabidopsis	`AT5G35450` (AT5G35450) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833508] identity=31.1; qcov=0.595; evalue=4.04e-77; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=31.8; qcov=0.612; evalue=9.11e-76; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000356

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057782210.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782210.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782210.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782210.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057782210.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:5707602`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr8:5707688`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B33,B46,B49
`Chr8:5707920`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B52,B78,C40
`Chr8:5707920`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B52,B78,C40
`Chr8:5707994`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A1,B107
`Chr8:5708096`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,C22
`Chr8:5708111`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	B7,B83,C11,C13,C59,C69,C81,D7
`Chr8:5708180`	`GAC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	11	A8,B123,B128,B21,B36,B58,B59,B64,C27,C46,D2
`Chr8:5708320`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:5708457`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr8:5708706`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B45,B52,C14
`Chr8:5708749`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,B58

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782210.1

1181 aa

590

1181

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF00931 NB-ARC 416-586 aa PF23559 WHD_DRP 670-739 aa PF23598 LRR_14 787-1091 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782210.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	416	586	4.7e-43	147.5	NB-ARC domain
`XP_057782210.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	670	739	2.6e-18	66.6	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057782210.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	787	1091	6.8e-17	62.0	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926227.1
AGTCGTCGCGTCGGCCGTTGTATACCACTCTCTCACATTCAATCAATCTTTGGCAGACTTTGGCTACACAGCTCCATCTCTCTCTTCCCTTTTGATTTGGTTGGATCCATTTTGATTTTAAGCAGCTCTTCAAGAAGAAATGTCGGCTTACGCTGCGCTGATTTCTCTCCACCAAATTCTGGTAACCATCGTTTACTTCCAACCGTGGATCACTCACAGCACAAATCAACTCCAAATCCTTATTATCAACGCCGCTTTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000356
ATGTCGGCTTACGCTGCGCTGATTTCTCTCCACCAAATTCTGGTAACCATCGTTTACTTCCAACCGTGGATCACTCACAGCACAAATCAACTCCAAATCCTTATTATCAACGCCGCTTTTCTGCTGAAATTTCTCGATGCCTCCTCTCGTGCCCAAACATCAGCTCTGGAGACGAAGATGAGGGATGCAGCTTACAAAGCAGAAGATCTTATCGAATTCGGAATTCTCGATTCCGAAAGCAGAATGTCCTACAGTCATAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782210.1
MSAYAALISLHQILVTIVYFQPWITHSTNQLQILIINAAFLLKFLDASSRAQTSALETKMRDAAYKAEDLIEFGILDSESRMSYSHMRITFFYCLYIIFVIVSGFLLLSYVKLEAVPARTEFILEIMYCLMNALFLYLCIREIYVFPPLDDSPELNRVLYDFEIIVMEANRISEAREMSSHEALVSLRRIVDYILDSGDKEQLRPLQEKVIFLLDFLGNPSTAYMSTLNLDATIRHAVSKAKRALIEFQLPRKFSLEFEW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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