当前解析结果
SmilChr08G000791| 统一新 Gene ID | SmilChr08G000791 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G000791 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G000791 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 5830653 - 5832824 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131000374 |
|---|---|
| GeneID | 131000374 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131000374 |
| 原始查询 | LOC131000374 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131000374 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Secreted | 分泌到胞外 | 0.80000 | XP_057782230.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057782230.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057782230.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057782230.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057782230.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:5831710 |
ATG |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 7 | B111,B120,B61,C14,C3,C35,C37 |
Chr8:5831723 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 5 | B111,C14,C3,C35,C37 |
Chr8:5831723 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B111,C14,C3,C35,C37 |
Chr8:5831724 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 5 | B111,C14,C3,C35,C37 |
Chr8:5831724 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B111,C14,C3,C35,C37 |
Chr8:5831729 |
T |
TA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 27 | A15,A16,A25,B110,B16,B18,B21,B26,B3,B51,B61,B69,B70,C10,C20,C26,C30,C44,C49,C62,C71,C75,C76,C8,C81,C83,D2 |
Chr8:5831747 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C20 |
Chr8:5831753 |
TGG |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 96 | A1,A10,A20,A4,A7,A8,B1,B102,B103,B105,B109,B111,B115,B118,B119,B120,B122,B123,B125,B132,B134,B139,B140,B15,B16,B18,B20,B24,B25,B3,B30,B31,B34,B36,B37,B42,B43,B44,B52,B54,B57,B58,B60,B61,B64,B66,B67,B68,B70,B71,B76,B80,B81,B84,B85,B86,B89,B91,B93,B95,B97,C15,C16,C17,C19,C2,C24,C27,C3,C30,C31,C34,C37,C38,C40,C44,C46,C48,C51,C53,C54,C57,C59,C7,C71,C72,C74,C8,C81,C82,C86,D11,D3,D5,D6,D7 |
Chr8:5831755 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B110,C10,D2 |
Chr8:5831761 |
TGC |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 18 | A15,A25,A6,B16,B18,B21,B3,B51,B61,B69,C26,C44,C49,C62,C71,C75,C76,C81 |
Chr8:5831796 |
CA |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | C81 |
Chr8:5831796 |
CA |
C |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | C81 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。