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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000793`

染色体: Chr08 坐标: 5836813-5839530 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000793`
名称	SmilChr08G000793
描述	pentatricopeptide repeat-containing protein At1g02370, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	5836813 - 5839530 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000375`
GeneID	`131000375`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000375`
原始查询	`LOC131000375`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pentatricopeptide repeat-containing protein At1g02370, mitochondrial-like
产物	pentatricopeptide repeat-containing protein At1g02370%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT1G02370` (AT1G02370) Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837735] identity=38.5; qcov=0.99; evalue=1.96e-119; confidence=medium
Rice	`Os01g0301000` - identity=37.9; qcov=0.899; evalue=2.54e-100; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005739 (mitochondrion)
KEGG	-
Pfam	PF01535 (PPR); PF13041 (PPR_2); PF13812 (PPR_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000375

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057782232.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782232.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782232.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782232.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057782232.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:5837087`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B103,B118,B45
`Chr8:5837146`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:5837157`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr8:5837262`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C78,C9
`Chr8:5837273`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr8:5837290`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D7
`Chr8:5837290`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D7
`Chr8:5838228`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,B88
`Chr8:5838247`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B17,B90,B92,C87
`Chr8:5838321`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr8:5838728`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr8:5838730`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C24,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782232.1

516 aa

258

516

PPR

PPR_3

PPR

PPR_2

PPR

PF01535 PPR 154-182 aa PF13812 PPR_3 189-231 aa PF01535 PPR 190-218 aa PF13041 PPR_2 190-232 aa PF01535 PPR 224-249 aa PF01535 PPR 367-390 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782232.1`	Pfam	`PF01535`	PPR	Repeat	154	182	6.1e-26	89.5	PPR repeat
`XP_057782232.1`	Pfam	`PF13812`	PPR_3	Repeat	189	231	2.3e-09	37.9	Pentatricopeptide repeat domain
`XP_057782232.1`	Pfam	`PF01535`	PPR	Repeat	190	218	6.1e-26	89.5	PPR repeat
`XP_057782232.1`	Pfam	`PF13041`	PPR_2	Repeat	190	232	3.9e-21	75.6	PPR repeat family
`XP_057782232.1`	Pfam	`PF01535`	PPR	Repeat	224	249	6.1e-26	89.5	PPR repeat
`XP_057782232.1`	Pfam	`PF01535`	PPR	Repeat	367	390	6.1e-26	89.5	PPR repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926249.1
AATGAGAACATGCTCGACTTGTAATTGATAAAAGTCGAGCGTTAGTGTATTTCTTAAAAATGTTCTATTGCTCGACTTGTAAAGTCGAACATGTCGAGCATTGGTGTATTTACTAAAGAGTTTATTTCTATTTCTAATAAAGTCGCACATCCCTGTCAGCGATTCTCCAGTTTCCGTTTCTATAGTGAAAAGCTGAATAAAATCCCAACCTAAAACCCTTCACTACCAGAGCCGTATTTACTATAATTATGGCGAATCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000375
ATGGCGAATCCCGGCTCTCGATTGCGCGCCGGAGCTTCTGCTTTGGTACGAATTTTCTCTGCGAAGCCTAGAGCGGGGACGGCGGCGGCGCAGCAGCTGCCGGCGCTCAAACAGGATGTCAGTGCGTCGCCGCAGCCGGAGCCTCTCCAACAGGAGGTCGGTTTGTACCGGAGATTGTCTCTTCTGGGGTGCACCGATGGAGAGGTGGCGAACGCCATTAATGAGTACACAAATGAAGGAAAAGTCATCAAAAAATCTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782232.1
MANPGSRLRAGASALVRIFSAKPRAGTAAAQQLPALKQDVSASPQPEPLQQEVGLYRRLSLLGCTDGEVANAINEYTNEGKVIKKSELEKCIKDFHKFKRYSHVLEIGEWMAHKFILKHKDIAIHLDAVAKVKGIAAAENYFNELRPSRRVKCTYAALLNCYCTEEMSDKAVDLFSKMVEQNMIDIPLPFNHLMMMYIRLGEPEKVIRLGEEMKKANVKPNTSTCSLLMSGYSLLNDFEGVERVLKEMTAESKKLVNWTT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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