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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000803`

染色体: Chr08 坐标: 5891389-5894783 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000803`
名称	SmilChr08G000803
描述	stachyose synthase
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	5891389 - 5894783 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000383`
GeneID	`131000383`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000383`
原始查询	`LOC131000383`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	stachyose synthase
产物	stachyose synthase
Arabidopsis	`AT4G01970` (STS) stachyose synthase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828186] identity=57.3; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0170000` (RS5) - identity=49.6; qcov=0.4; evalue=1.5e-118; confidence=low
GO	-
KEGG	smil00052 (Galactose metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF05691 (Raffinose_syn)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000383

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057782240.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057782240.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782240.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782240.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782240.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:5892063`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,C78,C9
`Chr8:5892066`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr8:5892093`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B27,B52,B66
`Chr8:5892156`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C12,C31
`Chr8:5892300`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B42
`Chr8:5892300`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B42
`Chr8:5892302`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B42
`Chr8:5892302`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B42
`Chr8:5892435`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B105,B124,C3
`Chr8:5892498`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,B122,B131
`Chr8:5892588`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B135,B85,C46
`Chr8:5892624`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782240.1

863 aa

432

863

Raffinose_syn

PF05691 Raffinose_syn 25-846 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782240.1`	Pfam	`PF05691`	Raffinose_syn	Family	25	846	0	1042.5	Raffinose synthase or seed imbibition protein Sip1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926257.1
AAATTAATTGTTATTTTTTTTGAGAGGGAGTTGGAAAATTAATTAATACAGAAGTTTCGCGCAGTCTCATTTTCGTCGCCTACACAGCTACACTTAACACTCTGTAGATTCGAGTCATTTCCCACTTCTCCATTGTTATGATATTGAGCTTTCACAAACCATTTCAAATTGGTATAAAGCGAGATAAATAGAATAAGTGAACAACACAGCATAAACCGCCCAACTTCTACCCCCCTCTTTTCTTTTGATTCTTTTTCCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000383
ATGGCGCCACCGAACGATCCCGCCAGCGCAATCTACACCGTTACGAAACCGACCAAAAACGACACCGTCTTCGACCTCTCCGGCGGGAAGCTCTCCGTGCAGAATGTGCCGCTGCTGTCGGATATTCCGGGCAACGTCACCTTCCGTAGCTTCTCCTCCGTGGTGAAATCCTCCTCCGCGCCGCCGGCGCTCTTCGACCGCGCGCTCTCCCTCTCCCACAGGGGCGGGTTCCTCGGCTTCAGCCAGCGCGCGGCGTCGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782240.1
MAPPNDPASAIYTVTKPTKNDTVFDLSGGKLSVQNVPLLSDIPGNVTFRSFSSVVKSSSAPPALFDRALSLSHRGGFLGFSQRAASDRLTTSIGKFTGRDFVSIFRFKTWWSTQWVGTSGSDIQMETQWIMLDVPEIKSYAVVIPIVDGSFRSALQPGADGHALLCAESGSSSVRTAALGAAAYVHVSDNPYTLMRDAYTAVRCHLGTFRLIEEKAPPPLVNKFGWCTWDAFYLTVEPAGIWHGVKEFAEGGLSPRFLII...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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