当前解析结果
SmilChr08G000806| 统一新 Gene ID | SmilChr08G000806 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G000806 |
| 描述 | transcription factor UPBEAT1 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 5934304 - 5935086 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131000387 |
|---|---|
| GeneID | 131000387 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131000387 |
| 原始查询 | LOC131000387 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | transcription factor UPBEAT1 |
| 产物 | transcription factor UPBEAT1 |
| Arabidopsis | AT2G47270 (UPB1)transcription factor UPBEAT protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819340] identity=50.9; qcov=0.538; evalue=2.86e-13; confidence=low |
| Rice | Os01g0630300- identity=48; qcov=0.472; evalue=5.08e-08; confidence=low |
| GO | GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0046983 (protein dimerization activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131000387 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057782242.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057782242.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057782242.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057782242.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057782242.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:5934508 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B44 |
Chr8:5934562 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C22,C48 |
Chr8:5934572 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr8:5934633 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B36 |
Chr8:5934637 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D4 |
Chr8:5934659 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B24,B35,B74,C25,C80 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。