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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001111`

染色体: Chr01 坐标: 22726595-22728504 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001111`
名称	SmilChr01G001111
描述	uncharacterized SmilChr01G001111
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	22726595 - 22728504 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000391`
GeneID	`131000391`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000391`
原始查询	`LOC131000391`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF20167 (Retrotransp-rel)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000391

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057782285.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057782285.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782285.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057782285.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057782285.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:22726609`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,B63,C84
`Chr1:22726629`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr1:22726633`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,B79
`Chr1:22726634`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	31	A1,A20,A21,B1,B10,B100,B101,B106,B114,B133,B30,B4,B45,B55,B6,B67,B73,B74,B87,B95,C16,C33,C45,C46,C5,C64,C66,C71,C77,D1,D3
`Chr1:22726687`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,B79
`Chr1:22726704`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A24
`Chr1:22726705`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,B127,C24,D8
`Chr1:22726727`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr1:22726734`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr1:22726788`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,A24
`Chr1:22726828`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C83,C86
`Chr1:22726854`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B59,B9,B98

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782285.1

622 aa

311

622

Retrotransp-rel

PF20167 Retrotransp-rel 327-489 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782285.1`	Pfam	`PF20167`	Retrotransp-rel	Domain	327	489	1.1e-23	84.7	Putative plant retrotransposon-related domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926302.1
ATGGACAAAAATCCTGATCTTTCCTCTCTCATCAAGAGTCTGATCCAACACTTTGGATCACCGGAAAGTGCTGCCAAACATCTCTCCGCCCTCCCTCAGATGGCCGAATCAACTGACAAACCCTCGTCTTCTCAAACTCCAGTGGAAGTCGCAGGAGGATCTTTTCCTCTAGCTCCTTCTCCAAAAGGCTCTCCGAAGAGAAGCACCACTGAATCGTCTGTAGGGGCTGATGTTGATCCTGTCTCTCTACAAATGGACTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000391
ATGGACAAAAATCCTGATCTTTCCTCTCTCATCAAGAGTCTGATCCAACACTTTGGATCACCGGAAAGTGCTGCCAAACATCTCTCCGCCCTCCCTCAGATGGCCGAATCAACTGACAAACCCTCGTCTTCTCAAACTCCAGTGGAAGTCGCAGGAGGATCTTTTCCTCTAGCTCCTTCTCCAAAAGGCTCTCCGAAGAGAAGCACCACTGAATCGTCTGTAGGGGCTGATGTTGATCCTGTCTCTCTACAAATGGACTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782285.1
MDKNPDLSSLIKSLIQHFGSPESAAKHLSALPQMAESTDKPSSSQTPVEVAGGSFPLAPSPKGSPKRSTTESSVGADVDPVSLQMDFQFGESIPSSKEESAYASPDTSLERIGEIAKEALLNLASQPGSDVDKASVVAEEECAAGDIPTSMDVDDSEKIPDVGQDVDPEESTDVIDVDTFVPDKKSRKRKAGVASLRRSSRLKSTRVIPSTLNLPSREDSDVGPTSRPPVLKPKVEHSPNSKSGKVSSTSHTTSPRISCS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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