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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000817`

染色体: Chr08 坐标: 6031047-6033165 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000817`
名称	SmilChr08G000817
描述	nifU-like protein 1, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	6031047 - 6033165 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000401`
GeneID	`131000401`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000401`
原始查询	`LOC131000401`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nifU-like protein 1, chloroplastic
产物	nifU-like protein 1%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT4G01940` (NFU1) NFU domain protein 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828196] identity=75.3; qcov=0.731; evalue=1.7e-85; confidence=high
Rice	`Os03g0314700` (OsISC11) - identity=76.6; qcov=0.713; evalue=1.72e-81; confidence=high
GO	GO:0005506 (iron ion binding); GO:0005739 (mitochondrion); GO:0016226 (iron-sulfur cluster assembly); GO:0051536 (iron-sulfur cluster binding)
KEGG	-
Pfam	PF01106 (NifU)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000401

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057782271.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057782271.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782271.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782271.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782271.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:6031197`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr8:6031223`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr8:6031297`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr8:6031415`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B133,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782271.1

216 aa

108

216

NifU

PF01106 NifU 75-137 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782271.1`	Pfam	`PF01106`	NifU	Family	75	137	5.1e-31	107.4	NifU-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926288.1
AAAATGAAAACGAAAAAGAAAATGAGTGGACAGAAAATGTTGGGTCCACCGGCTTCTTAGACTTCATACAAATCGAGAATTTTCTCTAATCGACTCACGGAGCTTCGCCCAAAACGACTATGGCATCCATGGCGACGGCGACGGCGACGGCGAGGACAACCTTCACGACTGCAGCACTAATCTCGTCACCTAAATCTTCGAAGATCGAATCTATCGGATTTCAATCAATCCAACCGCTCAATATCAGGCGGTTGAAACAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000401
ATGGCATCCATGGCGACGGCGACGGCGACGGCGAGGACAACCTTCACGACTGCAGCACTAATCTCGTCACCTAAATCTTCGAAGATCGAATCTATCGGATTTCAATCAATCCAACCGCTCAATATCAGGCGGTTGAAACAAAATCACCGGGGTTTTAATGTTGTAAAAGCATCGGCGTCTGGACTGTACTCCGCCGAGCATCTCGAGCTCACTGCGGAAAACGTAGACAAGGTTCTCGACAACGTCCGGCCGTACTTGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782271.1
MASMATATATARTTFTTAALISSPKSSKIESIGFQSIQPLNIRRLKQNHRGFNVVKASASGLYSAEHLELTAENVDKVLDNVRPYLITDGGNVDVVSVENGVVSLKLQGACESCPSSTTTMKMGIERVLKEKFGDEIKDICQVYDEQVTETTVEAVNNHLEILRPAIKNYGGSVEVLSVVGGDCVVRYIGPDSIGSGIKAAIKERFPDIANVQLTN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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