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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000836`

染色体: Chr08 坐标: 6187239-6195507 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000836`
名称	SmilChr08G000836
描述	gamma-tubulin complex component 4 homolog
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	6187239 - 6195507 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000419`
GeneID	`131000419`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000419`
原始查询	`LOC131000419`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	gamma-tubulin complex component 4 homolog
产物	gamma-tubulin complex component 4 homolog
Arabidopsis	`AT3G53760` (GCP4) GAMMA-TUBULIN COMPLEX PROTEIN 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824543] identity=71.9; qcov=0.995; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0154500` - identity=66.4; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000278 (mitotic cell cycle); GO:0000922 (spindle pole); GO:0000923 (equatorial microtubule organizing center); GO:0000930 (gamma-tubulin complex); GO:0005813 (centrosome); GO:0007020 (microtubule nucleation); GO:0031122 (cytoplasmic microtubule organization); GO:0043015 (gamma-tubulin binding); GO:0051011 (microtubule minus-end binding); GO:0051225 (spindle assembly); GO:0051321 (meiotic cell cycle)
KEGG	-
Pfam	PF04130 (GCP_C_terminal); PF17681 (GCP_N_terminal)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000419

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.40000	`XP_057782301.1`
2	Phragmoplast	Phragmoplast	0.40000	`XP_057782301.1`
3	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.40000	`XP_057782301.1`
4	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057782301.1`
5	Autophagosome	Autophagosome	0.20000	`XP_057782301.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:6187492`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B19,C39,C53
`Chr8:6187522`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B19,C39,C53
`Chr8:6188279`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B5,C22
`Chr8:6188291`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:6189682`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr8:6189697`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B101,B5,D10
`Chr8:6190957`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B114

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782301.1

741 aa

370

741

GCP_N_terminal

GCP_C_terminal

PF17681 GCP_N_terminal 2-387 aa PF04130 GCP_C_terminal 392-719 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782301.1`	Pfam	`PF17681`	GCP_N_terminal	Domain	2	387	7.3e-46	157.8	Gamma tubulin complex component N-terminal
`XP_057782301.1`	Pfam	`PF04130`	GCP_C_terminal	Domain	392	719	3.7e-59	201.4	Gamma tubulin complex component C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926318.1
TTGAAGCAACAAATTAGGAGCTCCCGCCGACCTTACTTAAAACGCCTATATCACTCAACTAGCCGAAAACATCAACACAGAAGCCGGATAATTACGTCACCGCCGCCGCCGCCGCCGCTGAATTCTCCGGTGAGTTCAGCTAAAAACTCTCAGTGAATTAATCCGCAACGATGCTTCACGAATTGCTATTGGCACTCTTAGGTTACACTGGAGATCTCATAATCGACGAGAGAGAACTCCAGGAATCACTCCGCATTAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000419
ATGCTTCACGAATTGCTATTGGCACTCTTAGGTTACACTGGAGATCTCATAATCGACGAGAGAGAACTCCAGGAATCACTCCGCATTAACTTATCCCCCGCGGCGCCGCTCGCCGACGAGCCGACGTTTAGGCTCGCATCCGATCTTTCGTTCATTGAACCTAGCGATAGGCAGGTAATTGAGAGGGTAATTACCCTAGGTTTCTACTACAGGGAGCTAGAACGCTTTGCTGCTAAATGTCGAAATTTGAGTTGGATCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782301.1
MLHELLLALLGYTGDLIIDERELQESLRINLSPAAPLADEPTFRLASDLSFIEPSDRQVIERVITLGFYYRELERFAAKCRNLSWIRSSNESPLSRATESLKGKKLKPSVYRRALANGIVEVLTIYRSAVLQIEQKLLSDSLPILATVTQGLNKFFVLLPPLYELILEIEHDNISGGRLLNLLHKRCHCGVPELQTCIQRLLWHGHQVMYNQLISWMVYGILHDQYGEFFISRQEDADSEHNLHADTIEKLSRLSPNDVT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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