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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000851`

染色体: Chr08 坐标: 6306654-6310947 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000851`
名称	SmilChr08G000851
描述	serine/arginine-rich splicing factor SR30-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	6306654 - 6310947 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000428`
GeneID	`131000428`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000428`
原始查询	`LOC131000428`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine/arginine-rich splicing factor SR30-like
产物	serine/arginine-rich splicing factor SR30-like
Arabidopsis	`AT1G09140` (SR30) SERINE-ARGININE PROTEIN 30 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837433] identity=70.4; qcov=0.537; evalue=6.11e-79; confidence=medium
Rice	`Os05g0364600` - identity=70.7; qcov=0.521; evalue=4.48e-80; confidence=medium
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:1990904 (ribonucleoprotein complex)
KEGG	smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000428

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057782313.1`
2	Nuclear speckle	核斑点	1.00000	`XP_057782313.1`
3	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057782313.1`
4	Chromatin	染色质	0.20000	`XP_057782313.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782313.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:6308503`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,D11
`Chr8:6308701`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,B139
`Chr8:6308924`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,D11
`Chr8:6308965`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782313.1

315 aa

158

315

RRM_1

PF00076 RRM_1 37-84 aa PF00076 RRM_1 119-181 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782313.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	37	84	5.7e-23	81.3	RNA recognition motif
`XP_057782313.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	119	181	5.7e-23	81.3	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XR_009093733.1
TTTTACCCCCCTTTTATTTTTATTTTCCCAAATTGCCCCTCTTTCCTTCAATCAGCCGCGTTTTAAAACCCTAATATTTTTTTTGTCACTCTTCTTCTCTATCCGGACCGTGTCGCTGCGCTCCGCTCTCCCATCTCTAGGTCTAGCAAAAATGAGTCGCTCTAGCAGAACTCTCTATGTTGGCAACCTTCCTGGGGACGTTCGTGAGCGCGAAGTGGAGGATCTTTTTTACAAGAGTGCATCTTAATATCCACATCTTT...

XR_009093734.1
TTTTACCCCCCTTTTATTTTTATTTTCCCAAATTGCCCCTCTTTCCTTCAATCAGCCGCGTTTTAAAACCCTAATATTTTTTTTGTCACTCTTCTTCTCTATCCGGACCGTGTCGCTGCGCTCCGCTCTCCCATCTCTAGGTCTAGCAAAAATGAGTCGCTCTAGCAGAACTCTCTATGTTGGCAACCTTCCTGGGGACGTTCGTGAGCGCGAAGTGGAGGATCTTTTTTACAAGAGTGCATCTTAATATCCACATCTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000428
ATGTTGGCAACCTTCCTGGGGACGTTCGTGAGCGCGAAGTGGAGGATCTTTTTTACAAGAGTGCATCTTAATATCCACATCTTTGACTGGTTCAATTTCATTTACTGGCAGTATGGATCAATTGTGCATATTGATCTTAAAATTCCCCCAAGGCCCCCTGGCTATGCTTTTGTTGAGTTTGAAGAGTCTCGGGATGCTGAAGATGCCATACGAGGGCGTGATGGCTATGATTTTGATGGGCATCGCCTACGGGTTGAGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782313.1
MLATFLGTFVSAKWRIFFTRVHLNIHIFDWFNFIYWQYGSIVHIDLKIPPRPPGYAFVEFEESRDAEDAIRGRDGYDFDGHRLRVELAHGGRGNSSSTDRQTGSRGPRGGVSRRSEYRVLVTGLPHSASWQDLKDHMRRAGDVCFSQVFHEGSGKTGIVDYTNFDDMKYAIKKLDGSEFRNAFSRARVHVKEYDSSRSRSRSRSRSRSRSRSRSPSYSKGRSNGRSKSKSPSISRSRSKSKSPKGKSSRRSRSRSRSLSR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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