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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000840`

染色体: Chr08 坐标: 6219245-6221952 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000840`
名称	SmilChr08G000840
描述	outer envelope pore protein 16-4, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	6219245 - 6221952 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000433`
GeneID	`131000433`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000433`
原始查询	`LOC131000433`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	outer envelope pore protein 16-4, chloroplastic
产物	outer envelope pore protein 16-4%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G62880` (ATOEP16-4) Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17/Tim22/Tim23 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825463] identity=55.2; qcov=0.967; evalue=1.54e-40; confidence=medium
Rice	`Os05g0111200` - identity=29; qcov=0.833; evalue=1.51e-08; confidence=low
GO	GO:0008320 (transmembrane protein transporter activity); GO:0030943 (mitochondrion targeting sequence binding); GO:0042721 (TIM22 mitochondrial import inner membrane insertion complex); GO:0045039 (protein insertion into mitochondrial inner membrane)
KEGG	-
Pfam	PF02466 (Tim17)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000433

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057782317.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057782317.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	0.20000	`XP_057782317.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782317.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782317.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:6220750`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr8:6221270`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr8:6221371`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr8:6221543`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	10	B109,B122,B13,B140,B25,C34,C48,C8,C82,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782317.1

130 aa

130

Tim17

PF02466 Tim17 20-117 aa

XP_057782318.1

120 aa

120

Tim17

PF02466 Tim17 20-108 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782317.1`	Pfam	`PF02466`	Tim17	Family	20	117	7.7e-13	49.5	Tim17/Tim22/Tim23/Pmp24 family
`XP_057782318.1`	Pfam	`PF02466`	Tim17	Family	20	108	7.7e-13	49.4	Tim17/Tim22/Tim23/Pmp24 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926335.1
AAGGAATTATTTGGAATTAAATTAAAGAAACTAAAATAAAAATTTCAAGAACTTATACCATACAAATCGGCGGCGCATCCGCATGCGAACCAAAGAGGCGGTGCTCCGCTCTTCGCCGCCGGCGGCCGAATAAAAAAAAGCTACATATCACCGTCGGAGCTAATTAAGTAATCCATCAAAATATGGAGGCAGATCTAGCGGATTACATGCCATGCTCTTCTATCGCAGTCGATTCCGTATTACGTATGAGCTCCGCTGGA...

XM_057926334.1
AGGAATTATTTGGAATTAAATTAAAGAAACTAAAATAAAAATTTCAAGAACTTATACCATACAAATCGGCGGCGCATCCGCATGCGAACCAAAGAGGCGGTGCTCCGCTCTTCGCCGCCGGCGGCCGAATAAAAAAAAGCTACATATCACCGTCGGAGCTAATTAAGTAATCCATCAAAATATGGAGGCAGATCTAGCGGATTACATGCCATGCTCTTCTATCGCAGTCGATTCCGTATTACGTATGAGCTCCGCTGGAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131000433
ATGGAGGCAGATCTAGCGGATTACATGCCATGCTCTTCTATCGCAGTCGATTCCGTATTACGTATGAGCTCCGCTGGAGTGATCTGGGGTGCTTGTTATGGCCCTTTTGATGCTGAAAGACTAGGTCTTTCTGGCAGCTCCCGAGCATCGTACATTGCCAAAACTGTTGGAAAGTGCGGGTTTTATTGCGGACTATTTGCTGGAATATTTTCTTTTGCTCACTGTGGAATACAAAGATATCGGCGGCGGAAAGACTGGGT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057782317.1
MEADLADYMPCSSIAVDSVLRMSSAGVIWGACYGPFDAERLGLSGSSRASYIAKTVGKCGFYCGLFAGIFSFAHCGIQRYRRRKDWVNTLSAGVVAGAAFGAGTRNWKQVAGITGLFCTFFQFAKDSKSV

XP_057782318.1
MEADLADYMPCSSIAVDSVLRMSSAGVIWGACYGPFDAERLGLSGSSRASYIAKTVGKCGFYCGLFAGIFSFAHCGIQRYRRRKDWVNTLSAGVVAGAAFGAGTRNWKQVAGVIGLPLSL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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