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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000847`

染色体: Chr08 坐标: 6283211-6285192 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000847`
名称	SmilChr08G000847
描述	mitochondrial zinc maintenance protein 1, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	6283211 - 6285192 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000435`
GeneID	`131000435`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000435`
原始查询	`LOC131000435`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mitochondrial zinc maintenance protein 1, mitochondrial
产物	mitochondrial zinc maintenance protein 1%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT3G62810` (AT3G62810) complex 1 family protein / LVR family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825456] identity=75.26; qcov=0.933; evalue=4.13e-50; confidence=medium
Rice	`Os05g0363600` - identity=60.22; qcov=0.885; evalue=1.4e-34; confidence=medium
GO	GO:0034551 (mitochondrial respiratory chain complex III assembly)
KEGG	-
Pfam	PF05347 (Complex1_LYR)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000435

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057782321.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	1.00000	`XP_057782321.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:6284239`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C32
`Chr8:6284286`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B34,B52,C23,D3
`Chr8:6284295`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr8:6284337`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,C46
`Chr8:6284348`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B121,C42,C5
`Chr8:6284367`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	A13,B124,B2,B27,B67,B93,C45,C46,C50,C59,C60,D7
`Chr8:6284371`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B29,B61,D11
`Chr8:6284446`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B119,B13,B132,B26,C49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782321.1

104 aa

104

Complex1_LYR

PF05347 Complex1_LYR 6-61 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782321.1`	Pfam	`PF05347`	Complex1_LYR	Family	6	61	1.4e-10	41.6	Complex 1 protein (LYR family)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926338.1
TTCGCTCGGTAAAAGTATAGGACTTTTACCATTTTTGACGCTAATTAAAAGTATAGTATTTTTCGTTTTAAGACATATTCTATCATTTATTTTTGTACTTTACTCTTATAAATACCATTAATTATAAAACAAAATTTTGCTCTACCTCGCACTTAATTCATTCTCAACTATTTATTTTGACCATTTGTCTATCAAAATACATTTATTAATTATTTTATTAAAACTTGCATTCAACTAAATTGTTATATATTTGTGACAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000435
ATGGGGAGCGAGGCAGCATTGACGGCGTACAGAGCGTTGCTGAGAGCGACTCGGAAGACATTCGCCGGCGACACGCTGATGCTCAGGCAGTCCGCCGCCGAGGTGCGGAAGAAGTTCGAGGAGAATCGTCACGTGACCTCCGCCGCCGACCTCAGCCGCCTCCTGGAGGAGGCACGTGAGGCCTCCCACTTCATCTCCACCATGATCGTCCAAGCCAAGCTCAACGACCGCGGTGGCTACGAAGTGAAGCCTGATAAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782321.1
MGSEAALTAYRALLRATRKTFAGDTLMLRQSAAEVRKKFEENRHVTSAADLSRLLEEAREASHFISTMIVQAKLNDRGGYEVKPDKEHAGATLEIPSEEILKNA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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