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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004212`

染色体: Chr01 坐标: 60545745-60547150 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004212`
名称	SmilChr01G004212
描述	photosynthetic NDH subunit of subcomplex B 2, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	60545745 - 60547150 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000448`
GeneID	`131000448`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000448`
原始查询	`LOC131000448`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	photosynthetic NDH subunit of subcomplex B 2, chloroplastic
产物	photosynthetic NDH subunit of subcomplex B 2%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G64770` (PnsB2) NDH-dependent cyclic electron flow 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842785] identity=58.8; qcov=1.03; evalue=2.59e-140; confidence=high
Rice	`Os03g0158300` - identity=57; qcov=0.945; evalue=2.52e-131; confidence=high
GO	GO:0003824 (catalytic activity); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process); GO:0030246 (carbohydrate binding)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000448

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057782343.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057782343.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.20000	`XP_057782343.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782343.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782343.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:60545890`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B27,B75,C47
`Chr1:60545943`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr1:60545982`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr1:60546010`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr1:60546129`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B28,B35,B5,C40
`Chr1:60546495`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr1:60546677`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B27,C47
`Chr1:60546687`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr1:60546771`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,C50
`Chr1:60546908`	`T`	`TGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	89	A1,A14,A15,A18,A19,A20,A5,A8,A9,B10,B102,B103,B108,B111,B120,B121,B127,B13,B130,B136,B139,B14,B16,B18,B19,B2,B20,B21,B24,B3,B32,B33,B34,B38,B39,B40,B46,B52,B58,B64,B65,B66,B68,B69,B70,B71,B72,B73,B74,B77,B78,B79,B81,B86,B87,B9,B91,B98,C10,C12,C13,C16,C20,C21,C23,C24,C29,C33,C34,C35,C36,C38,C4,C41,C42,C44,C45,C49,C50,C52,C60,C71,C73,C83,C84,C86,C9,D1,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926360.1
TGGGGTAGTATAAAAACAAAAACAATAGTTAGTTAGTAAGTAAGTGCAGGAAGAGGCGGAGGTGGGTCTATCCAAAAAATAGAGGGGATGGGACGAGGTAAATATTTGCTGGTGGAGAGAGATCCTCTTGCTTAGCTTAATCTGTGAGAGTTGAGTGAGTGAGAATGGCTTCGCTTCTATCCTTCTCCCCCCTTAAATCTGCTAAAGCTTGTGCTGCGCCTTCAACTGCAACTGCAACTGCGACAGAGAGTCTTGACCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000448
ATGGCTTCGCTTCTATCCTTCTCCCCCCTTAAATCTGCTAAAGCTTGTGCTGCGCCTTCAACTGCAACTGCAACTGCGACAGAGAGTCTTGACCAGAAATTCGGACGCAAAGGCATAAAGTTTTCAGATTCGGCGACGGTTGAGCTGAGCGTCAGAAATGGAAGCTCCGTGAAGCTCGACATTCCAAATGGCCACATTACTTCCTACAAGCCCAAGGTCTACTGGAAGGACGATGGCTACGAGGAGGTCCTTCACACTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782343.1
MASLLSFSPLKSAKACAAPSTATATATESLDQKFGRKGIKFSDSATVELSVRNGSSVKLDIPNGHITSYKPKVYWKDDGYEEVLHTLPPSPSSSSSRGGIALVVDNLSSQPNPNTSATSHWTVKDVDSDSIDALQVELGCIRGSLDITYVVSLYPLSMATAVIVKNNGRKPVDLATAILSHLKVKKRGGSGVQGLKGCSYCTHPPLSSPFQILSPSEATKSEDPGGFFSFGWEPENKVGVWSVQDAPITVLRHKLSRVYA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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