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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000867`

染色体: Chr08 坐标: 6438206-6439007 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000867`
名称	SmilChr08G000867
描述	translocator protein homolog
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	6438206 - 6439007 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000455`
GeneID	`131000455`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000455`
原始查询	`LOC131000455`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	translocator protein homolog
产物	translocator protein homolog
Arabidopsis	`AT2G47770` (TSPO) TSPO(outer membrane tryptophan-rich sensory protein)-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819389] identity=42.8; qcov=1.04; evalue=5.58e-47; confidence=medium
Rice	`Os05g0151200` - identity=39.4; qcov=0.856; evalue=8.92e-13; confidence=low
GO	GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF03073 (TspO_MBR)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000455

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057782354.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.60000	`XP_057782354.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782354.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782354.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782354.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:6438592`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14
`Chr8:6438623`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,C26
`Chr8:6438628`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:6438692`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B17,C78,C9,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782354.1

187 aa

187

TspO_MBR

PF03073 TspO_MBR 46-184 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782354.1`	Pfam	`PF03073`	TspO_MBR	Family	46	184	7.9e-30	104.2	TspO/MBR family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926371.1
CATGCAAATCTACGAGATAAACACGCTCCACCCTACATAATCTCCGCCACCTCCTCCCCACCACTCAACTCACCAATATGGCTTCCCCCGACCTCAAACACCGCCCCATCCAACAGCAAACCGCCCCCGACGAAGACGACATGAACCACCACCACCGCAAAAAGCCCAAGAACGCGGCCGCCCACCGCGGGCTGCGGTCGCTGAGCGTGGCCGTGGCCCTGCCCCTCTCCCTCAGCGTCCTCGACATCTTCCTCTTCGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000455
ATGGCTTCCCCCGACCTCAAACACCGCCCCATCCAACAGCAAACCGCCCCCGACGAAGACGACATGAACCACCACCACCGCAAAAAGCCCAAGAACGCGGCCGCCCACCGCGGGCTGCGGTCGCTGAGCGTGGCCGTGGCCCTGCCCCTCTCCCTCAGCGTCCTCGACATCTTCCTCTTCGGCTCCTCCAGCCGCTACCGCAGCCTCGACAAGCCCTTCTACGTGCCCCCGCTCTGGGCCCTGCACCTCGCCTGCGTCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782354.1
MASPDLKHRPIQQQTAPDEDDMNHHHRKKPKNAAAHRGLRSLSVAVALPLSLSVLDIFLFGSSSRYRSLDKPFYVPPLWALHLACVSTAFLSGLSAWLVWAEGGFHRHPAALGLYLGQLALSLVWYPVVFGAGAIRVGLLLCAALFGVLLGCARAFRNMNPIAGDLVKPCLAWALLLAAANVRLVYQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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