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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000869`

染色体: Chr08 坐标: 6442921-6447219 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000869`
名称	SmilChr08G000869
描述	dol-P-Man:Man(5)GlcNAc(2)-PP-Dol alpha-1,3-mannosyltransferase
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	6442921 - 6447219 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000456`
GeneID	`131000456`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000456`
原始查询	`LOC131000456`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dol-P-Man:Man(5)GlcNAc(2)-PP-Dol alpha-1,3-mannosyltransferase
产物	dol-P-Man:Man(5)GlcNAc(2)-PP-Dol alpha-1%2C3-mannosyltransferase
Arabidopsis	`AT2G47760` (ALG3) asparagine-linked glycosylation 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819388] identity=65.9; qcov=0.989; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0172000` - identity=71.6; qcov=0.195; evalue=4.91e-41; confidence=weak
GO	GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0006486 (GO:0006486); GO:0052925 (dol-P-Man:Man(5)GlcNAc(2)-PP-Dol alpha-1,3-mannosyltransferase activity)
KEGG	smil00510 (N-Glycan biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00513 (Various types of N-glycan biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF05208 (ALG3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000456

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057782355.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057782355.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782355.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782355.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782355.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:6443259`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B35,B94,C33,C61
`Chr8:6443288`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B99,C87
`Chr8:6443734`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B35,B94,C33,C61
`Chr8:6444686`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr8:6444802`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:6445016`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B36,D10
`Chr8:6445156`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr8:6445466`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr8:6445479`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr8:6445799`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,C2
`Chr8:6445824`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr8:6445825`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B37,C15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782355.1

451 aa

226

451

ALG3

PF05208 ALG3 42-413 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782355.1`	Pfam	`PF05208`	ALG3	Family	42	413	1.8e-135	452.7	ALG3 protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926372.1
AATGAATTTTTTTTTTTGAAAGGGGTCAAACGAATGAGTTAGTTTGTAACTTTTTCTGCTTTAATTTATTTTGTGTGATGAATTAGCTAAATCCTATTCCTCGAATGTCAAAATTCGGCCTAATCATCTGACCCGAAACGCAGCGTTTCACGTCAACCGTTTAGCTTCAGTGTAAAACCGCGCAACCAGTCTCAGCCGGCGTCGAACGCTTCCCTCCGATGCCGCGACACGCCTCCGACACTCGATCCGCCTCCGCCGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000456
ATGCCGCGACACGCCTCCGACACTCGATCCGCCTCCGCCGCCGTCGGATTGAAGTTGTCGGCGAAAAAAAACACGTCTTTTATTCAAAAAACAATAAAAAACCCCAAGTTATCATCCGCCGTCGCCGTGCTCCTCGCGGACGTCGTCCTGGTTTCTCTCATCATCGCATATGTTCCATATACGAAAATTGATTGGGATGCTTACATGTCACAGGTTAGTGGTTTTCTGGGAGGTGAAAGAGATTACAGCAAACTGAAAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782355.1
MPRHASDTRSASAAVGLKLSAKKNTSFIQKTIKNPKLSSAVAVLLADVVLVSLIIAYVPYTKIDWDAYMSQVSGFLGGERDYSKLKGDTGPLVYPAGFLYIYSAIQYVTGGEVYPAQILFGILYIVNLGMVLLIYLKTDVLPWWALCLLSLSKRLHSIFVLRLFNDCFATTLFHAALISFLYQKWHLGLIIFSGAVSVKMNVLLFAPPLLLLLLKGMDVFGVISAGAGAAVVQILLGLPFILSYPVAYFSRAFNLGRVFV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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