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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000875`

染色体: Chr08 坐标: 6488992-6490259 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000875`
名称	SmilChr08G000875
描述	heavy metal-associated isoprenylated plant protein 36-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	6488992 - 6490259 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000461`
GeneID	`131000461`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000461`
原始查询	`LOC131000461`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	heavy metal-associated isoprenylated plant protein 36-like
产物	heavy metal-associated isoprenylated plant protein 36-like
Arabidopsis	`AT5G27690` (AT5G27690) Heavy metal transport/detoxification superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832831] identity=60.9; qcov=0.254; evalue=3.22e-25; confidence=weak
Rice	`Os01g0125600` (P0044F08.14) - identity=62.3; qcov=0.254; evalue=1.65e-24; confidence=weak
GO	GO:0046872 (metal ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00403 (HMA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000461

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057782360.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057782360.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057782360.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057782360.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782360.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:6489207`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B99,C87
`Chr8:6489255`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	A25,A5,B113,B90,B91,B92,C44,C53
`Chr8:6489286`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B129,B79,C15,C77
`Chr8:6489472`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	62	A1,A14,A18,A21,A6,B105,B110,B114,B119,B120,B124,B125,B130,B137,B139,B15,B16,B22,B26,B32,B38,B39,B4,B42,B43,B49,B51,B52,B6,B60,B63,B70,B81,B85,B87,B91,B93,C14,C21,C28,C29,C3,C30,C37,C38,C40,C41,C47,C5,C58,C63,C64,C67,C71,C72,C73,C76,C78,C83,C9,D4,D9
`Chr8:6489517`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,C15
`Chr8:6489547`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B60,B87,C38
`Chr8:6489570`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B66,B8,C28,C4
`Chr8:6489582`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B43
`Chr8:6489637`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr8:6489699`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B42,B43
`Chr8:6489699`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B42,B43
`Chr8:6489718`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782360.1

272 aa

136

272

HMA

PF00403 HMA 38-90 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782360.1`	Pfam	`PF00403`	HMA	Domain	38	90	1.5e-14	54.8	Heavy-metal-associated domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926377.1
TTTTATACTAGACTAGAGTAGGCTACAACTTCCATTTTAGTTTCTCCTCTCTTATTCTTCTCCGCTTTCACTAACGCGCAGGCTCCATGGAAAAAGCTCCAGATGCTGACGGCGACAGTGGCGATGGCGATGGCGGCCCCGGCCCCGGCGCCGGCGCCGGCGAAGGCTCCCCACCCCTCACCTATAAGACATGGATCTTGAGAGTGTCAATTCATTGTGGCGGATGCAAAAAGAAAGTAAAGAAAGTCCTTCAAAATATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000461
ATGGAAAAAGCTCCAGATGCTGACGGCGACAGTGGCGATGGCGATGGCGGCCCCGGCCCCGGCGCCGGCGCCGGCGAAGGCTCCCCACCCCTCACCTATAAGACATGGATCTTGAGAGTGTCAATTCATTGTGGCGGATGCAAAAAGAAAGTAAAGAAAGTCCTTCAAAATATTGAAGGAGTGTATAAGATAGAGATAGATTCCAAACAGCACAGAGTTGAGGTAACGGGCAACGTCGAATCTGGGACGTTGATCAAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782360.1
MEKAPDADGDSGDGDGGPGPGAGAGEGSPPLTYKTWILRVSIHCGGCKKKVKKVLQNIEGVYKIEIDSKQHRVEVTGNVESGTLIKKLIRSGKNAELWSEKQSKDGDAAAGDSGEKRVDLADGPKNGCDSSGEDHAEEKGDGQVAAAQGGGGGGKKKKKKKKKKGNAGGAPAPAPAPAPGGSGWPPPAAASGGPVDQANESCPRQQVFSYPQFYYPAAEYGMSYNSAPPNASMANSYYTLPMYSYAYESYPTNLSSDSII...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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