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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000877`

染色体: Chr08 坐标: 6491624-6493406 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000877`
名称	SmilChr08G000877
描述	pentatricopeptide repeat-containing protein At5g66520-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	6491624 - 6493406 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000462`
GeneID	`131000462`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000462`
原始查询	`LOC131000462`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pentatricopeptide repeat-containing protein At5g66520-like
产物	pentatricopeptide repeat-containing protein At5g66520-like
Arabidopsis	`AT5G66520` (AT5G66520) Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836784] identity=35; qcov=1.03; evalue=1.49e-100; confidence=low
Rice	`Os01g0764950` (P0403C05.21-1) - identity=41.7; qcov=0.979; evalue=7.69e-124; confidence=medium
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0005515 (protein binding); GO:0009451 (RNA modification)
KEGG	-
Pfam	PF01535 (PPR); PF13041 (PPR_2); PF13812 (PPR_3); PF20431 (E_motif)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000462

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057782361.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782361.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782361.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782361.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057782361.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:6491789`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr8:6491823`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B60,B70
`Chr8:6491837`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B124,B50,B65,B99,C56
`Chr8:6491886`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr8:6492064`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B60,B68,B87,C38
`Chr8:6492097`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:6492209`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B36,B42,B43
`Chr8:6492633`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B81
`Chr8:6492702`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B70
`Chr8:6492723`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B14,B46,B67,B98,C14
`Chr8:6492738`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:6492952`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,B31,C56,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782361.1

468 aa

234

468

PPR

PPR_2

PPR

PPR_2

PPR_3

PPR

PPR_3

PPR

E_motif

PF01535 PPR 149-174 aa PF13041 PPR_2 174-213 aa PF01535 PPR 177-207 aa PF01535 PPR 250-277 aa PF13041 PPR_2 275-324 aa PF13812 PPR_3 276-324 aa PF01535 PPR 278-308 aa PF13812 PPR_3 302-358 aa PF01535 PPR 351-375 aa PF20431 E_motif 396-455 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782361.1`	Pfam	`PF01535`	PPR	Repeat	149	174	1e-31	107.6	PPR repeat
`XP_057782361.1`	Pfam	`PF13041`	PPR_2	Repeat	174	213	1e-38	131.9	PPR repeat family
`XP_057782361.1`	Pfam	`PF01535`	PPR	Repeat	177	207	1e-31	107.6	PPR repeat
`XP_057782361.1`	Pfam	`PF01535`	PPR	Repeat	250	277	1e-31	107.6	PPR repeat
`XP_057782361.1`	Pfam	`PF13041`	PPR_2	Repeat	275	324	1e-38	131.9	PPR repeat family
`XP_057782361.1`	Pfam	`PF13812`	PPR_3	Repeat	276	324	9.2e-17	61.6	Pentatricopeptide repeat domain
`XP_057782361.1`	Pfam	`PF01535`	PPR	Repeat	278	308	1e-31	107.6	PPR repeat
`XP_057782361.1`	Pfam	`PF13812`	PPR_3	Repeat	302	358	9.2e-17	61.6	Pentatricopeptide repeat domain
`XP_057782361.1`	Pfam	`PF01535`	PPR	Repeat	351	375	1e-31	107.6	PPR repeat
`XP_057782361.1`	Pfam	`PF20431`	E_motif	Repeat	396	455	1e-15	58.4	E motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926378.1
TTTGTTATTTCTTCATGATTTCTTGCTTCTTGTTTGGCCCTTTGAAATTCGACTTTGAGCGGCAGCCCACAGTCATCCACGAATGGCAGAAATTCTCAATTCTGCAGCTGCAAGAATCCTCCATTCCTTAACTACTCGCTGCAAAACTCCGCCGCACCTCTCCCAGATTCTAGCGCAGCTGGTCGTCCACAATCTCACCGCTAACACCACTGTCGCCGCCGCCTTCATCTCCTCCTGCCGCTCACTCAACCTCCTCACCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000462
ATGGCAGAAATTCTCAATTCTGCAGCTGCAAGAATCCTCCATTCCTTAACTACTCGCTGCAAAACTCCGCCGCACCTCTCCCAGATTCTAGCGCAGCTGGTCGTCCACAATCTCACCGCTAACACCACTGTCGCCGCCGCCTTCATCTCCTCCTGCCGCTCACTCAACCTCCTCACCTCCGCCGCCTTCCCCCTCTTCATAAACAACCACACCAGGCCCCACACCTTCGTCTGCAACACTCTTCTCAGAGCCTTCTCTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782361.1
MAEILNSAAARILHSLTTRCKTPPHLSQILAQLVVHNLTANTTVAAAFISSCRSLNLLTSAAFPLFINNHTRPHTFVCNTLLRAFSHSNAPHTSPIIYSHMHTNFIRANHYTFPFVLKAAADLKLIKGGAAVHGQIIRLGFLSDLYVGNSLLNLYAAGGDMALCRKVFDEMPVRDVVSWTVVISGFKDYGRFNDALLAFETMRSEGVMPNQVTAVNALAACAGFGALHTGVWIHDYVKRHEWELDVILGTSLIEMYGRCG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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