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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000882`

染色体: Chr08 坐标: 6520877-6524840 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000882`
名称	SmilChr08G000882
描述	autophagy-related protein 18a
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	6520877 - 6524840 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000469`
GeneID	`131000469`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000469`
原始查询	`LOC131000469`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	autophagy-related protein 18a
产物	autophagy-related protein 18a
Arabidopsis	`AT3G62770` (AtATG18a) Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825452] identity=71.2; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0934000` (OsATG18c) - identity=73.1; qcov=0.838; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000422 (autophagy of mitochondrion); GO:0005515 (protein binding); GO:0005829 (cytosol); GO:0006497 (protein lipidation); GO:0019898 (extrinsic component of membrane); GO:0032266 (phosphatidylinositol-3-phosphate binding); GO:0034045 (phagophore assembly site membrane); GO:0034497 (protein localization to phagophore assembly site); GO:0044804 (nucleophagy); GO:0080025 (phosphatidylinositol-3,5-bisphosphate binding)
KEGG	-
Pfam	PF00400 (WD40); PF21032 (PROPPIN); PF21034 (BCAS3_WD40)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000469

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057782366.1`
2	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.40000	`XP_057782366.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057782366.1`
4	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.40000	`XP_057782366.1`
5	Endosome	内体	0.20000	`XP_057782366.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:6522057`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B30,B98
`Chr8:6522084`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B134,D4
`Chr8:6522699`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B1,B37,C16,C40
`Chr8:6522737`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,A4
`Chr8:6523714`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A25,B113,C44,C46
`Chr8:6523749`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr8:6523984`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B86
`Chr8:6523984`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B86
`Chr8:6524190`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,C26
`Chr8:6524366`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B45
`Chr8:6524497`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B4
`Chr8:6524497`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782366.1

431 aa

216

431

PROPPIN

WD40

BCAS3_WD40

WD40

PF21032 PROPPIN 84-330 aa PF00400 WD40 246-278 aa PF21034 BCAS3_WD40 248-334 aa PF00400 WD40 298-324 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782366.1`	Pfam	`PF21032`	PROPPIN	Repeat	84	330	4.9e-35	122.0	PROPPIN
`XP_057782366.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	246	278	1.2e-11	45.3	WD domain, G-beta repeat
`XP_057782366.1`	Pfam	`PF21034`	BCAS3_WD40	Repeat	248	334	2.3e-14	53.6	BCAS3, WD40 repeat
`XP_057782366.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	298	324	1.2e-11	45.3	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926383.1
GATAAGGAAGATGACACGTCACTCTCTGTTATTGTTTAATTTTTACATTACGTGCCCTCCAATTAACGAATCGTATACAGTGACAACACTTCGTCTTTGTCCCAATAAATTACCCTTTTTGTCCCTTGATGGCTCCGAATTTCCCAAGGCTACAATCGTCAATTCACTGCCTTTCTTCTTAGCCTCCCTCATCGCTTCGATCCTTTGCGCCCCCAAAATCATCCGTTCCTCCCCTTTTCCCGTAATTCCATCCGGGTCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000469
ATGGCCACCATATCGAGCCTCGCCTCCCATCCAAACCCTAACCCTAATCCCAATCTGATCTCCCCCATGCTCCAGCCTTACCTCGAGCAGCAGCAGGAGCGCCTCCAGCCCGACACGCCGCCGGACGACGGAGGATCCCCCTACGATGCTGTTCCCGACACCGATGACCGCGATTCCTCCACCGCCGCCAACAATAACCCCGCCGTTCTCACCCCCAACCTAAACCCTAGCCCGATCAAGCTCCTCCACGTCTCTTTCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782366.1
MATISSLASHPNPNPNPNLISPMLQPYLEQQQERLQPDTPPDDGGSPYDAVPDTDDRDSSTAANNNPAVLTPNLNPSPIKLLHVSFNQDYGCFATGTDRGFRIYNCDPFREIFRRDFDGNGGGVGAVEMLFRCNILALVGGGDSPQYPLNKVMIWDDHQSRCIGELSFRSEVRGVRLRRDRIIVVLEQKIFVYNFADLKLLHQIETIANPKGLCAVSQVAGSFVLVCPGLQKGQVRVEHYASKRTKFIMAHDSRIACFTL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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