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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004215`

染色体: Chr01 坐标: 60550357-60556955 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004215`
名称	SmilChr01G004215
描述	casein kinase 1-like protein HD16
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	60550357 - 60556955 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000475`
GeneID	`131000475`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000475`
原始查询	`LOC131000475`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	casein kinase 1-like protein HD16
产物	casein kinase 1-like protein HD16
Arabidopsis	`AT3G03940` (AT3G03940) Protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819551] identity=86; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0772600` (CK1_CaseinKinase_1a.3) - identity=79.1; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004674 (protein serine/threonine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006897 (endocytosis); GO:0007165 (signal transduction); GO:0018105 (peptidyl-serine phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF17667 (Pkinase_fungal); PF24289 (DUF7477)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000475

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057782381.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057782381.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057782381.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057782381.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782381.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:60551720`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,C50
`Chr1:60553898`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B109,B64,B78
`Chr1:60553973`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr1:60555137`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B109,B64,B78
`Chr1:60555276`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr1:60555428`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,B40,C62
`Chr1:60555809`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B27,C47
`Chr1:60556298`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B27,C47
`Chr1:60556379`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B27,C47
`Chr1:60556469`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B55,C50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782381.1

705 aa

352

705

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

Pkinase_fungal

DUF7477

PF00069 Pkinase 143-379 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 144-412 aa PF17667 Pkinase_fungal 255-354 aa PF24289 DUF7477 438-704 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782381.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	143	379	3e-16	60.3	Protein kinase domain
`XP_057782381.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	144	412	6.9e-06	26.3	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057782381.1`	Pfam	`PF17667`	Pkinase_fungal	Domain	255	354	3.3e-08	33.4	Fungal protein kinase
`XP_057782381.1`	Pfam	`PF24289`	DUF7477	Repeat	438	704	9e-162	537.2	Domain of unknown function (DUF7477)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926398.1
TATATATATATATATATATTTGCATAGAGAGAGAAGGAGGCAGACAAGCAGTAGATGTTGTGTGTAGAGAGAGAGACAAGGAGGATAGCCATAGAATCTATAGCAGCTATACACCGATACATTACAATACACAACGCCTTTCCCTAATTTTTCTACCTCGAGTTTCTTCTCTCCTTTTCTTCGATATCCACACCCGGAAACTGCATCCCTCACTCTTTAAAACTTCAGATTCTTAACAATACATCTTTATCATTTTTCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000475
ATGCCAGAATTGCGTAGCGGAGCACGGAGATCAAAACGGCTTGGTGATCTCCAGCCTGCCCCTCAACCTGCTAATCAAGAAGAAAATTTCCTCGCACCTGCTCAGAATAGAACCAGAAGGAGGGGAAGAGGGAGAGGCAATGCAGCTGGTGTAGCTAAAGGGCCTTCTGCAGCAACACCCGCAAGACCAACTGCTGCTGGTAGAGGCAGGGGGATTAGGTTGATAGATTTAGACCCAGAGCCACCTTGTGAGATTCTTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782381.1
MPELRSGARRSKRLGDLQPAPQPANQEENFLAPAQNRTRRRGRGRGNAAGVAKGPSAATPARPTAAGRGRGIRLIDLDPEPPCEILPQAGVGAGDPACNKIEGVADKEIAMEGGSADKVMGVEEEPSSTPVPERVQVGNSPMYKTERKLGKGGFGQVYVGRRVSGGTSERMGPDAIEVALKFEHRNSKGCNYGPPYEWQVYNSLNGCYGIPWVHYKGRQGDFYILVMDMLGPSLWDVWNSLGQTMSPSMAACIAVEAISI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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