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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000889`

染色体: Chr08 坐标: 6585624-6593244 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000889`
名称	SmilChr08G000889
描述	cysteine-tryptophan domain-containing zinc finger protein 7
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	6585624 - 6593244 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000477`
GeneID	`131000477`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000477`
原始查询	`LOC131000477`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cysteine-tryptophan domain-containing zinc finger protein 7
产物	cysteine-tryptophan domain-containing zinc finger protein 7
Arabidopsis	`AT1G02990` (AT1G02990) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839380] identity=55; qcov=0.167; evalue=1.41e-76; confidence=weak
Rice	`Os03g0347300` (OsCW-ZF3) - identity=46.4; qcov=0.187; evalue=8.66e-68; confidence=weak
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF07496 (zf-CW); PF18876 (AFF4_CHD); PF24756 (THD_CWZF3-5-7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000477

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057782380.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057782380.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782380.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782380.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057782380.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:6585881`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,B140,C2,C82
`Chr8:6585927`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,C10
`Chr8:6586221`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,B140,C2,C82
`Chr8:6586275`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,C26
`Chr8:6586765`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A25,C48
`Chr8:6586786`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:6587537`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,B140,C2,C82
`Chr8:6587587`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,C10
`Chr8:6587609`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr8:6587610`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,B46
`Chr8:6588278`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	129	A10,A14,A19,A2,A22,A23,A25,A3,A5,A7,A8,A9,B100,B103,B104,B107,B108,B111,B113,B114,B115,B117,B118,B12,B121,B123,B126,B128,B13,B132,B133,B135,B140,B19,B2,B21,B22,B23,B25,B27,B29,B3,B31,B33,B34,B35,B37,B4,B40,B45,B47,B48,B5,B59,B61,B62,B64,B66,B68,B7,B71,B72,B74,B76,B78,B79,B8,B80,B81,B82,B84,B87,B89,B9,B90,B92,B94,B95,B97,B98,C14,C19,C2,C23,C25,C26,C27,C32,C33,C38,C39,C4,C43,C44,C45,C48,C49,C50,C52,C53,C54,C55,C56,C57,C59,C6,C61,C62,C64,C65,C66,C68,C70,C71,C74,C77,C78,C8,C80,C81,C82,C86,C87,C9,D2,D3,D5,D7,D8
`Chr8:6588379`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,B140,C2,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782380.1

1633 aa

816

1633

zf-CW

THD_CWZF3-5-7

AFF4_CHD

PF07496 zf-CW 650-695 aa PF24756 THD_CWZF3-5-7 1379-1632 aa PF18876 AFF4_CHD 1385-1514 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782380.1`	Pfam	`PF07496`	zf-CW	Domain	650	695	2.3e-15	57.0	CW-type Zinc Finger
`XP_057782380.1`	Pfam	`PF24756`	THD_CWZF3-5-7	Domain	1379	1632	1.5e-84	284.4	CWZF3-5-7 THD domain
`XP_057782380.1`	Pfam	`PF18876`	AFF4_CHD	Domain	1385	1514	3e-05	24.3	AFF4, C-terminal homology domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926397.1
AAACAAAATAGTAAGAGAAACAAACGCGGCTGCTGAACCAGAGTCCTTTCTCTCTCCTCTCTCTCTCTAAACATTTTTCTCTCTCTACTTTTTTTTTTCCTGCTCAACGTTTTGAGCTTCAGAGATCGCATAACACGATCCAATTTCCACGATACGTGAATCAAGCGAGTTCTCAGATTCACAATAAATTGAAAATTTGTCGAGTTTTTTCCTCCCGAGTGTAGATTGGTATATTGCCGAGCAAAATTAGCCTTTTTTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000477
ATGATATCTGTGGGCAGTAGAGATGGTAGAAAGAGGATAGGTTTGGGATTAGATATGGAAGAAACTGAGCTTGAAGAAGGAGAGGCTCTCGGTTATCACGAGGAGGGAGAAGATTCCACCATTGACCCTGATATTGCTCTCTCTTACATTGAGGAAAAAGTCCATAGATTTTTGGGTCACCTCCAGAAAGATTTTGAAGGTGGTGTTTCAGCTGAGAATTTGGGGGCGAAATTTGGTGGCTATGGTTCATTTTTACCTAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782380.1
MISVGSRDGRKRIGLGLDMEETELEEGEALGYHEEGEDSTIDPDIALSYIEEKVHRFLGHLQKDFEGGVSAENLGAKFGGYGSFLPTYQRSPSWSHTKSPAEAHNYESPRSPRKPHTEDQRQNSLASSSASPSIRPHAASGKSLSVGSSLKGNGYLKAKHAEESSLKSEINKKSVNDQRTLKVRIKVGSENLSAQKNAEIYSGLGLVVSPSSSMDDSPTTSEGQCVKLLGVPEASPTSILQIMTSYSGELLLSPLSEDLI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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