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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000895`

染色体: Chr08 坐标: 6633184-6634895 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000895`
名称	SmilChr08G000895
描述	chalcone--flavanone isomerase-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	6633184 - 6634895 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000484`
GeneID	`131000484`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000484`
原始查询	`LOC131000484`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	chalcone--flavanone isomerase-like
产物	chalcone--flavanone isomerase-like
Arabidopsis	`AT3G55120` (TT5) Chalcone-flavanone isomerase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824678] identity=65; qcov=0.951; evalue=1.76e-99; confidence=high
Rice	`Os03g0819600` (gh1) - identity=63; qcov=0.96; evalue=1.73e-97; confidence=high
GO	GO:0009813 (flavonoid biosynthetic process); GO:0045430 (chalcone isomerase activity)
KEGG	smil00941 (Flavonoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02431 (Chalcone)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000484

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057782387.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057782387.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782387.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782387.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782387.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:6633797`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B14,B60,B87,C38
`Chr8:6633851`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,B63,C16
`Chr8:6633984`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B87,C38
`Chr8:6634080`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B45,B71,C71,C77,C9
`Chr8:6634081`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C21
`Chr8:6634089`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B60,B87,C38
`Chr8:6634093`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B61,C74
`Chr8:6634204`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B26,C19
`Chr8:6634327`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr8:6634329`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B19,B61,B64,B69,C62
`Chr8:6634333`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11
`Chr8:6634356`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B26,C19

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782387.1

225 aa

112

225

Chalcone

PF02431 Chalcone 12-214 aa

XP_057782388.1

225 aa

112

225

Chalcone

PF02431 Chalcone 12-214 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782387.1`	Pfam	`PF02431`	Chalcone	Domain	12	214	2.7e-95	318.3	Chalcone-flavanone isomerase
`XP_057782388.1`	Pfam	`PF02431`	Chalcone	Domain	12	214	2.7e-95	318.3	Chalcone-flavanone isomerase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926404.1
CGGCTGAAATCTGAAGGGCTGGTAGGTAAAACTCGTGGTGGCTATCGCCTAGCGTGACGTTACTAACCTAACCTCAGCTCCCTACACCCCATTGTTATTAACCACCTTCATCTTCACCTTCACCTTCAACTCTGCAACATACTCCGACTGCGAGAAAATGTCTGCAACGCCAACCGTAACACAGCTCCAAGTGGAGTCCGTGGTATTCCCACCCACAGCGAAGCCACCGGGCTCCGACAAGACGTTATTCCTCGGCGGCG...

XM_057926405.1
AAAATTAGTGGTACCAGTGAATAATTATGATGTAGAATCAAATCTTTCTGATATTTGAACAAATGCTGATTTCCACCAAAGTATTTAATTGGTTGAATGAGTATTCATGAATGAACAGGGCTGGTAGGTAAAACTCGTGGTGGCTATCGCCTAGCGTGACGTTACTAACCTAACCTCAGCTCCCTACACCCCATTGTTATTAACCACCTTCATCTTCACCTTCACCTTCAACTCTGCAACATACTCCGACTGCGAGAAAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131000484
ATGTCTGCAACGCCAACCGTAACACAGCTCCAAGTGGAGTCCGTGGTATTCCCACCCACAGCGAAGCCACCGGGCTCCGACAAGACGTTATTCCTCGGCGGCGCAGGGGTGCGAGGGATGGAGATCCAAGGGAATTTCGTCAAATTCACCGCCATCGCCGTCTACATGGAGGGCACCGCCATCCCCGCGCTCGCGCCCAAGTGGGGCGCCAAAACCGTCGATGAACTGGCCGATTCCGCCGACTTCATTCGCGAAATCAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057782387.1
MSATPTVTQLQVESVVFPPTAKPPGSDKTLFLGGAGVRGMEIQGNFVKFTAIAVYMEGTAIPALAPKWGAKTVDELADSADFIREIIAGPFEKLTKVTMILPLTGQQYSEKVAENCTAYWKAVGKYTDAEGKAVEEFLQVFKDESFSPGASILFTQSPAGSLTIAFSKDGSIPEQGKAVIENKLLAEAILESIIGKQGVSPTARQSLAARVSKLLKQTSLAAEAQ

XP_057782388.1
MSATPTVTQLQVESVVFPPTAKPPGSDKTLFLGGAGVRGMEIQGNFVKFTAIAVYMEGTAIPALAPKWGAKTVDELADSADFIREIIAGPFEKLTKVTMILPLTGQQYSEKVAENCTAYWKAVGKYTDAEGKAVEEFLQVFKDESFSPGASILFTQSPAGSLTIAFSKDGSIPEQGKAVIENKLLAEAILESIIGKQGVSPTARQSLAARVSKLLKQTSLAAEAQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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