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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000906`

染色体: Chr08 坐标: 6702514-6703481 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000906`
名称	SmilChr08G000906
描述	uncharacterized SmilChr08G000906
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	6702514 - 6703481 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000492`
GeneID	`131000492`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000492`
原始查询	`LOC131000492`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os09g0268600; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os09g0268600; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G05850` (MUG7) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859] identity=26.6; qcov=0.846; evalue=8.82e-12; confidence=low
Rice	`Os09g0268600` - identity=28.5; qcov=0.88; evalue=8.18e-26; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000492

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057782398.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057782398.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782398.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782398.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057782398.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:6702540`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B17,B21,B97
`Chr8:6702544`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B102,B53,B94,C33,C41
`Chr8:6702581`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B56
`Chr8:6702583`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B78,C9
`Chr8:6702584`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,B23
`Chr8:6702646`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr8:6702652`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B42,C1,C16,C52
`Chr8:6702693`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14
`Chr8:6702712`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:6702734`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,B26,C19
`Chr8:6702745`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr8:6702806`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B56,B96

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782398.1

267 aa

134

267

SWIM

PF04434 SWIM 87-117 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782398.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	87	117	3.7e-08	33.4	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926415.1
ACGCACGAGCTTCATGACGTCGAATGCTGCCGAGACGATGAACAGTAGACTGTTGTGGGCACGACGCCTCCCGGTTGCTTCATTGATCGAGACCTATCGAGCCATTATGGAGAAATGGTTCGATAGGCGACGCATCTCGGCTGCATCGAGGTCACATGAGTTGACTGAGGTAGTAGAGGGAAAGTTTCATGTGGCTGTCGAAGCGGGTCGACAATTGGCCGTTCGAGGGACGACGACGCACATGTTTAGTATTGAGGATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000492
ATGACGTCGAATGCTGCCGAGACGATGAACAGTAGACTGTTGTGGGCACGACGCCTCCCGGTTGCTTCATTGATCGAGACCTATCGAGCCATTATGGAGAAATGGTTCGATAGGCGACGCATCTCGGCTGCATCGAGGTCACATGAGTTGACTGAGGTAGTAGAGGGAAAGTTTCATGTGGCTGTCGAAGCGGGTCGACAATTGGCCGTTCGAGGGACGACGACGCACATGTTTAGTATTGAGGATGATCATGCATTCTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782398.1
MTSNAAETMNSRLLWARRLPVASLIETYRAIMEKWFDRRRISAASRSHELTEVVEGKFHVAVEAGRQLAVRGTTTHMFSIEDDHAFYIVDLENRTCSCAQFDLDDIPCRHACAAIRRAGLQVTDFVGGYFKQSVLLATYMERIVPVPHPTYWNVPDEISAYVVKPPDITVHAGRPKLSRARSAVEGPPNSGPPNSGTPNSRPQVCSRCKGGGHNARRCKAQVGPLDLNVPVEGVEQPPDARRRRKKKCGICRSGTHTRNA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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