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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000909`

染色体: Chr08 坐标: 6717403-6721064 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000909`
名称	SmilChr08G000909
描述	membrane-anchored ubiquitin-fold protein 3-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	6717403 - 6721064 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000497`
GeneID	`131000497`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000497`
原始查询	`LOC131000497`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	membrane-anchored ubiquitin-fold protein 3-like
产物	membrane-anchored ubiquitin-fold protein 3-like
Arabidopsis	`AT1G22050` (MUB6) membrane-anchored ubiquitin-fold protein 6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838810] identity=50.9; qcov=0.949; evalue=5.8e-36; confidence=medium
Rice	`Os02g0750600` (MUB3) - identity=50; qcov=0.983; evalue=6.23e-39; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF13881 (Rad60-SLD_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000497

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057782407.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057782407.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057782407.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057782407.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782407.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:6718569`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B18
`Chr8:6718587`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A11,A3,C42
`Chr8:6718587`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A11,A3,C42
`Chr8:6720216`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	24	A24,A25,B101,B113,B126,B127,B13,B25,B31,B37,B54,B80,C16,C2,C22,C34,C4,C40,C44,C47,C71,C78,C9,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782407.1

118 aa

118

Rad60-SLD_2

PF13881 Rad60-SLD_2 9-116 aa

XP_057782408.1

118 aa

118

Rad60-SLD_2

PF13881 Rad60-SLD_2 9-116 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782407.1`	Pfam	`PF13881`	Rad60-SLD_2	Domain	9	116	6.2e-32	110.7	Ubiquitin-2 like Rad60 SUMO-like
`XP_057782408.1`	Pfam	`PF13881`	Rad60-SLD_2	Domain	9	116	6.2e-32	110.7	Ubiquitin-2 like Rad60 SUMO-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009093748.1
CCCTCACTCCTAAAAGATACTACTACTGCTACAAGAGAAAGAAAAGCGTGAAAACGCCACCGAATCGTCTCTCTCTACGGAGCTCACATTCTCGACGACTATTCACATCTTATTCTTTTATTTATTTTTACCGGCGGAGGCGGAGCAGCTCTCTCGGCCGCGCGAAATTTTGTCTCCGCCCCTGATTGGTATTCGTATATATGGCGTCTTGATCAGGGACTTCTTTTGAGGTTTCCTGCGATAATTGAAGGTTTTGGATC...

XM_057926424.1
TTTTTGTTTGTTTGGAGCAAGAGCGCATCGTATTTTTCTTAGAAAGGGAATAAAAGAAAATTTTGACTCCCTCACTCCTAAAAGATACTACTACTGCTACAAGAGAAAGAAAAGCGTGAAAACGCCACCGAATCGTCTCTCTCTACGGAGCTCACATTCTCGACGACTATTCACATCTTATTCTTTTATTTATTTTTACCGGCGGAGGCGGAGCAGCTCTCTCGGCCGCGCGAAATTTTGTCTCCGCCCCTGATTGGTAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131000497
ATGGCTACTACAACTGAAGGAAGTGAGAGCCTTCAACTGAAATTCAGAATATTTGATGGGACAGATATAGGTCACGGGACATACTTTTCTTCCATCACCGCTGCTACACTTAAACAAAAACTTCTTTCTGAGTGGCCTCAAGATAAATCAGTTGTGCCAAAGTCAGTGAGCGATATGAAACTGATACATGCTGGAAAAGTTTTAGAGAATGGGCAGAGACTTGCTGACTCTGGTTTATGTGTCGGCAACCTTACAGGTGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057782407.1
MATTTEGSESLQLKFRIFDGTDIGHGTYFSSITAATLKQKLLSEWPQDKSVVPKSVSDMKLIHAGKVLENGQRLADSGLCVGNLTGEVITMHVVVQPSVAEQKSGKKQDQHSCSCTIL

XP_057782408.1
MATTTEGSESLQLKFRIFDGTDIGHGTYFSSITAATLKQKLLSEWPQDKSVVPKSVSDMKLIHAGKVLENGQRLADSGLCVGNLTGEVITMHVVVQPSVAEQKSGKKQDQHSCSCTIL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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