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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000916`

染色体: Chr08 坐标: 6781406-6783708 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000916`
名称	SmilChr08G000916
描述	tubby-like F-box protein 3
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	6781406 - 6783708 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000502`
GeneID	`131000502`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000502`
原始查询	`LOC131000502`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tubby-like F-box protein 3
产物	tubby-like F-box protein 3
Arabidopsis	`AT2G47900` (TLP3) tubby like protein 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819402] identity=67.8; qcov=1.04; evalue=2.94e-171; confidence=high
Rice	`Os07g0667000` (OsTLP7) - identity=61; qcov=1.01; evalue=2.31e-156; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF01167 (Tub)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000502

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057782416.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057782416.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057782416.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782416.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782416.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:6781767`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B18,D8
`Chr8:6781812`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr8:6781926`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr8:6782298`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B103,B104,B132
`Chr8:6782352`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B104
`Chr8:6782352`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B104
`Chr8:6782492`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,B24

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782416.1

349 aa

174

349

Tub

PF01167 Tub 73-344 aa

XP_057782417.1

349 aa

174

349

Tub

PF01167 Tub 73-344 aa

XP_057782418.1

349 aa

174

349

Tub

PF01167 Tub 73-344 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782416.1`	Pfam	`PF01167`	Tub	Domain	73	344	1.2e-101	340.5	Tub family
`XP_057782417.1`	Pfam	`PF01167`	Tub	Domain	73	344	1.2e-101	340.5	Tub family
`XP_057782418.1`	Pfam	`PF01167`	Tub	Domain	73	344	1.2e-101	340.5	Tub family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926435.1
AACATTATTAATTGATTATTATTCCCCTCGTGAAGAAAACTCAACTCATAAAGCATAAAAAACAGGAGACAAAAATTCGCAAAACCTAACAGATAAAATCATCTCCATTTCCCAACTATATATATAAAGATACTCCTCACGCCTTTTTAAAGCTGTAATTGTCTAACAAATACGCATCACACAGCACAATATCTTGCGTTCTTGCAGAGCAACCATATCTAACTTCTCAAACCGATCCACGTTGCTGTTCATCTCCAGCT...

XM_057926433.1
ATAAAGCATAAAAAACAGGAGACAAAAATTCGCAAAACCTAACAGATAAAATCATCTCCATTTCCCAACTATATATATAAAGATACTCCTCACGCCTTTTTAAAGCTGTAATTGTCTAACAAATACGCATCACACAGCACAATATCTTGCGTTCTTGCAGAGCAACCATATCTAACTTCTCAAACCGATCCACGTTGCTGTTCATCTCCAGCTAGGGGATTATATTTGTGTTTGCCAATTTTTGTGTAAGAATTAGGGAA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131000502
ATGAGGTCAAGGAGTGATGATGATGGCGTTGAGTTGAGTTGGTGGGCAAACATGCCGGCGGAGCTGTTGAGGGATGTGCTGATGCGGATTGAGGAATCCGAATCCACGTGGCGTCGGAGAAACAGTGTGGTTGCCTGTGCTGGTGTTTGCAGGAGCTGGAGGCACATCATCAAAGACATTGTCGCCACTTCTGGGAGGCTCACATTTCCCATTTCTCTCAAGCAGCCTGGTCCAAGAAGCTCTTGGATTCAATGTTTCAT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057782416.1
MRSRSDDDGVELSWWANMPAELLRDVLMRIEESESTWRRRNSVVACAGVCRSWRHIIKDIVATSGRLTFPISLKQPGPRSSWIQCFIKRNRGMQTYHLYLNLSQASNDDGKFLLAARRCRRPTYTDYIISLKSDDVLKGSSNYFGKLRSNFLGTKFTIYDTQPPNGVARVARSRSTRMVGTRQVSPRVPSGNYPVAHVSYELNVLGSRGPRRMQCVMDAIGASIVEPEGATELLPANLDSFPALPFLRSKSTSTDGYQSV...

XP_057782417.1
MRSRSDDDGVELSWWANMPAELLRDVLMRIEESESTWRRRNSVVACAGVCRSWRHIIKDIVATSGRLTFPISLKQPGPRSSWIQCFIKRNRGMQTYHLYLNLSQASNDDGKFLLAARRCRRPTYTDYIISLKSDDVLKGSSNYFGKLRSNFLGTKFTIYDTQPPNGVARVARSRSTRMVGTRQVSPRVPSGNYPVAHVSYELNVLGSRGPRRMQCVMDAIGASIVEPEGATELLPANLDSFPALPFLRSKSTSTDGYQSV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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