当前解析结果
SmilChr08G000918| 统一新 Gene ID | SmilChr08G000918 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G000918 |
| 描述 | classical arabinogalactan protein 26-like |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 6789569 - 6790260 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131000504 |
|---|---|
| GeneID | 131000504 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131000504 |
| 原始查询 | LOC131000504 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | classical arabinogalactan protein 26-like |
| 产物 | classical arabinogalactan protein 26-like |
| Arabidopsis | AT2G47930 (AGP26)arabinogalactan protein 26 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819405] identity=43.6; qcov=0.692; evalue=2.28e-08; confidence=low |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131000504 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 1.00000 | XP_057782423.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057782423.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057782423.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057782423.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057782423.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:6789732 |
TA |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 79 | A1,A14,A15,A24,A6,A9,B100,B105,B109,B110,B111,B121,B128,B130,B131,B133,B136,B138,B139,B19,B2,B24,B27,B31,B34,B36,B45,B48,B5,B50,B53,B55,B62,B65,B69,B70,B71,B72,B73,B74,B76,B78,B81,B82,B84,B86,B87,B88,B9,B94,B95,B97,B99,C1,C11,C19,C29,C31,C39,C4,C42,C5,C50,C51,C52,C53,C54,C56,C64,C66,C69,C73,C74,C75,C77,C78,C87,D3,D5 |
Chr8:6789793 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B109,B24 |
Chr8:6789992 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C12,C65 |
Chr8:6790056 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B108,C28,C82 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。