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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000921`

染色体: Chr08 坐标: 6798611-6809101 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000921`
名称	SmilChr08G000921
描述	protease Do-like 2, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	6798611 - 6809101 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000505`
GeneID	`131000505`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000505`
原始查询	`LOC131000505`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protease Do-like 2, chloroplastic
产物	protease Do-like 2%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT2G47940` (DEG2) DEGP protease 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819406] identity=69.2; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0147500` (OsDegp6) - identity=73.7; qcov=0.833; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004252 (serine-type endopeptidase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00089 (Trypsin); PF13365 (Trypsin_2); PF17815 (PDZ_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000505

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057782424.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.60000	`XP_057782424.1`
3	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057782424.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782424.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782424.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:6800160`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr8:6800569`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	A24,D5
`Chr8:6802259`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C56
`Chr8:6803263`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B7,B71
`Chr8:6804656`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr8:6807407`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B117,B24,C23
`Chr8:6808217`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr8:6808251`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782424.1

621 aa

310

621

Trypsin

Trypsin_2

PDZ_3

PF00089 Trypsin 140-321 aa PF13365 Trypsin_2 160-298 aa PF17815 PDZ_3 445-586 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782424.1`	Pfam	`PF00089`	Trypsin	Domain	140	321	2e-21	77.6	Trypsin
`XP_057782424.1`	Pfam	`PF13365`	Trypsin_2	Domain	160	298	9.3e-24	85.5	Trypsin-like peptidase domain
`XP_057782424.1`	Pfam	`PF17815`	PDZ_3	Domain	445	586	1.1e-45	155.6	PDZ domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926441.1
TATTTTTTCTTTTTCTTTTTATGTTAAAATTGGATTTATTTATTTTTTTAGGCAAAAAAATTGGATATTTTTTGTATGCGTTAAAGGAAGGATAAGGAAAGAGCAGACCATCTTGGCGCCCCCTGCGTTGCCGGACTTTTTAAATGGCAGTCGCCGCCGCTAACTGTTGTTTCTTCGCCGCCGCATTCACCGGCCTCTCCACCACCCACCGCCTCCTCTCCACTTGGCGTAGACCTAACTATTTATGTAGTGCTCACAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000505
ATGGCAGTCGCCGCCGCTAACTGTTGTTTCTTCGCCGCCGCATTCACCGGCCTCTCCACCACCCACCGCCTCCTCTCCACTTGGCGTAGACCTAACTATTTATGTAGTGCTCACAATAAATCCTCTGACAATCAGAATCGAGCTCCTGTTAAAGGAAAACCTAAGAAATCACCCGGCAATTACCCCATTGAGAACGAATATATCACGCAGAAGTTATCAAGGAGATCAAGAGACGAGAAGTCCTTTTCAAATGCTGATGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782424.1
MAVAAANCCFFAAAFTGLSTTHRLLSTWRRPNYLCSAHNKSSDNQNRAPVKGKPKKSPGNYPIENEYITQKLSRRSRDEKSFSNADGSKNERSQSTASKGVAVQKKGNQGILVDSEEQKVETSDIQDASFLNAVVKVYCTHTEPDYSLPWQKQKQYTSTGSAFMIGDGKLLTNAHCVEYNTQVKVKRRGDDTKYIAKVLARGVECDLALLFVESKEFWEGTEPLHFGRLPNLQDSVTVVGYPLGGETISVSKGVVSRIEV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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