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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000928`

染色体: Chr08 坐标: 6850795-6855889 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000928`
名称	SmilChr08G000928
描述	RNA-binding protein BRN1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	6850795 - 6855889 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000512`
GeneID	`131000512`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000512`
原始查询	`LOC131000512`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RNA-binding protein BRN1-like
产物	RNA-binding protein BRN1-like
Arabidopsis	`AT4G03110` (RBP-DR1) RNA-binding protein-defense related 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828090] identity=66.8; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0938200` - identity=69.2; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:1990904 (ribonucleoprotein complex)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000512

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057782438.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057782438.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.80000	`XP_057782440.1`
4	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.80000	`XP_057782440.1`
5	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057782438.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:6851456`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A14
`Chr8:6853607`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B2,C74
`Chr8:6854498`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B48,C21
`Chr8:6854550`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr8:6855290`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr8:6855297`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782438.1

426 aa

213

426

RRM_1

PF00076 RRM_1 9-72 aa PF00076 RRM_1 97-165 aa PF00076 RRM_1 343-413 aa

XP_057782440.1

410 aa

205

410

RRM_1

PF00076 RRM_1 9-72 aa PF00076 RRM_1 97-165 aa PF00076 RRM_1 327-397 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782438.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	9	72	6.3e-55	183.7	RNA recognition motif
`XP_057782438.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	97	165	6.3e-55	183.7	RNA recognition motif
`XP_057782438.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	343	413	6.3e-55	183.7	RNA recognition motif
`XP_057782440.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	9	72	5.3e-55	183.9	RNA recognition motif
`XP_057782440.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	97	165	5.3e-55	183.9	RNA recognition motif
`XP_057782440.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	327	397	5.3e-55	183.9	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926455.1
CAATCGCGGAGTTGGGCTGAGCATCAACCGTTTAGAAACCGAAGCCAGTGGCATTCCCCCGTAATTAACCCTCTAAACCGAGGGCAATCTCGCTGTATTCAATTAATATAAATAAAAACCACGGAGAAGATCCCAACTTTGCAATCTAGACAATTCCCCTAATTATTTATTTTATTTTTTTACAAGCGAAGACTCGGTGCAGAGCAACAAGAAGAAAAAAATTATGCTCTCGGATCATCATTGAGTAGTTTCGTCGAGGA...

XM_057926457.1
CAACTTTGCAATCTAGACAATTCCCCTAATTATTTATTTTATTTTTTTACAAGCGAAGACTCGGTGCAGAGCAACAAGAAGAAAAAAATTATGCTCTCGGATCATCATTGAGTAGTTTCGTCGAGGAGAAGTTTTTCGTGCAGTTGGGGGGAGAGAGGGGGAGTAAATTTAGAGAGAGAAACTCTTCCTGCCGCGGTGTAATAATAATGGCGGAGGAGGAGAGCGTCAAGTTGTTCGTGGGTCAAGTGCCCAAGCACATG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131000512
ATGGCGGAGGAGGAGAGCGTCAAGTTGTTCGTGGGTCAAGTGCCCAAGCACATGACGGAATCGCAGCTGCTCGCAATGTTCAAGGAGTTCGCCTCAGTGGACGAAGTCAACATTATCAAGGACAAGACCACGCGTGCTTCTCGAGGATGTTGTTTTGTGATATGTCCGTCGAGAGAGGAAGCGGACAAGGCGATTAGTGAGTGTCATAATAAGAAGACGCTGCCTGGGGCATCTAGTCCGTTGCAAGTGAAGTATGCTGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057782438.1
MAEEESVKLFVGQVPKHMTESQLLAMFKEFASVDEVNIIKDKTTRASRGCCFVICPSREEADKAISECHNKKTLPGASSPLQVKYADGELERLEHKLFIGMLPKNVSDAEVSALFSNYGTIKDLQLLRGYQQTSKGCAFLKFETKEQALAAIEALNGKHKIEGSTVPLVVKWADTEKERQTRRAQKALSLASNVPNPDSRQHLYGALPMGYMPPYNGYGYQTPGTYGLMHYRLPPLQNQHAFHNLIPPLNQGNAIRGVTP...

XP_057782440.1
MAEEESVKLFVGQVPKHMTESQLLAMFKEFASVDEVNIIKDKTTRASRGCCFVICPSREEADKAISECHNKKTLPGASSPLQVKYADGELERLEHKLFIGMLPKNVSDAEVSALFSNYGTIKDLQLLRGYQQTSKGCAFLKFETKEQALAAIEALNGKHKIEGSTVPLVVKWADTEKERQTRRAQKALSLASNVPNPDSRQHLYGALPMGYMPPYNGYGYQNQHAFHNLIPPLNQGNAIRGVTPDLSSGMAPRSYTVSPA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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