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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000930`

染色体: Chr08 坐标: 6880970-6883898 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000930`
名称	SmilChr08G000930
描述	rho GTPase-activating protein 2-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	6880970 - 6883898 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000513`
GeneID	`131000513`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000513`
原始查询	`LOC131000513`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	rho GTPase-activating protein 2-like
产物	rho GTPase-activating protein 2-like
Arabidopsis	`AT4G03100` (AT4G03100) Rho GTPase activating protein with PAK-box/P21-Rho-binding domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828092] identity=69.3; qcov=0.86; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0533400` - identity=67.8; qcov=0.685; evalue=2.79e-158; confidence=high
GO	GO:0005096 (GTPase activator activity); GO:0007165 (signal transduction)
KEGG	-
Pfam	PF00620 (RhoGAP); PF00786 (PBD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000513

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057782441.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057782441.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057782441.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782441.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782441.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:6881314`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,A4,B112,B26
`Chr8:6881390`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C19
`Chr8:6881603`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,B24
`Chr8:6881608`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C48
`Chr8:6881608`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C48
`Chr8:6881651`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,C43
`Chr8:6882027`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr8:6882368`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B58,D4
`Chr8:6882386`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58
`Chr8:6882407`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B58
`Chr8:6882407`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B58
`Chr8:6882415`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782441.1

463 aa

232

463

PBD

RhoGAP

PF00786 PBD 68-95 aa PF00620 RhoGAP 132-265 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782441.1`	Pfam	`PF00786`	PBD	Domain	68	95	5.6e-05	24.1	P21-Rho-binding domain
`XP_057782441.1`	Pfam	`PF00620`	RhoGAP	Domain	132	265	6.3e-22	78.8	RhoGAP domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926458.1
AAACAAGAATTTGAAATGAGTGGCCGTTTGAATAAACAGTGTAAATAACACATTAGTTCAAACTTCAAAAAACCCCACTTCCTTCCTTCAATGCACCAACATCAATAAAAACAAAAAAACTCAATTTTCTTCCTTCGAATTCGCCCATTTTTATCTCTCTCTAGAGAGATAAACAACACCAGCCGTATACACATCTTCGAGGGAGAGAGAGAGAGAGAGAAGAGGAGCTCGATACCATGACTGGAATGGTTATGGTGACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000513
ATGACTGGAATGGTTATGGTGACGAGGGGCGGTGGCTGCGCCGGCAAGAGCTCAAAATCCGCTGCAGCTGAGGAGCACGATAAGCAGCAGCAGCAGCTCTCTTTGCTAGATTTCATTTTATCAGCTCTGAGAAAATCAATGGTGTCTACGTGCCGCATCGACAGACAAGATCAGGAAGTGATATCGGCCGTCCATCACATGGAAATCGGGTGGCCCACAAACGTTCAGCACATAACTCATGTCACATTTGATAGATTCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782441.1
MTGMVMVTRGGGCAGKSSKSAAAEEHDKQQQQLSLLDFILSALRKSMVSTCRIDRQDQEVISAVHHMEIGWPTNVQHITHVTFDRFHGFLGLPVEFEVEVPCRAPSASVSVFGVSAESMQCSYDNRGNSVPTILLLMQDRLYSQDGLKSEGIFRINPENGQEEHVRDELNRGIVPKDIDVHCLAGLIKAWFRELPSGVLDGLSPEQVLQCNTEEEAVELIKQLKPTESALLNWAVDLMADVVEHEESNKMNARNIAMVFS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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