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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001041`

染色体: Chr08 坐标: 7935906-7940189 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001041`
名称	SmilChr08G001041
描述	uncharacterized SmilChr08G001041
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	7935906 - 7940189 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000528`
GeneID	`131000528`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000528`
原始查询	`LOC131000528`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glycosyltransferase family protein 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836191]; symbol=AT5G60700; hit=AT5G60700; species=arabidopsis; confidence=high
产物	glycosyltransferase family protein 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836191]; symbol=AT5G60700; hit=AT5G60700; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G60700` (AT5G60700) glycosyltransferase family protein 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836191] identity=78.2; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0806500` - identity=71; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF28143 (SPBC1E8_03c_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000528

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057782471.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057782471.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782471.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782471.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782471.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:7937222`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,C27
`Chr8:7937297`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr8:7937298`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr8:7937363`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B38
`Chr8:7937363`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B38
`Chr8:7937477`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr8:7937525`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B21,B64,C12,C27
`Chr8:7937590`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr8:7937763`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:7937835`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B37,C6
`Chr8:7937903`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B91,C41,C53
`Chr8:7938035`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782471.1

934 aa

467

934

SPBC1E8_03c_C

PF28143 SPBC1E8_03c_C 615-790 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782471.1`	Pfam	`PF28143`	SPBC1E8_03c_C	Domain	615	790	8.2e-37	127.2	SPBC1E8.03c C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926488.1
TCTTCTCCTCCTACCCTGCAGAAAGAAAACTGGTCAGAATCCAAAAAAGAAAATAAAAAAATGATAAAATTAATTAGCTGAAGAATTAAACACGGTTCGAAAGAGCCGCACAAGATTGAATCATCCACAATTACAAGCAAAATCAGTTCCAAAAAAAGTTTAGGCCAAACGGCAATAGCAAAGGTTGCTGCAAAATGCATCTACGCTCAACATCTTAGTACAAACAAAACAGCTGCCAAAAGTCAACCCCTCAAGCCCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000528
ATGGGAATGTCGAGAAACGTGAGAAGCGGTGATTATTTGGAGGGAATGCTGAGTGATTACATGGGTGGGAAGGGGGCTAAGTTGAAGGTGCAGAAGAGCTCCCCATCTAAGCTTGTCACAGTGCTAACATGCTTGCAGTTCGCCTTCGCCGTCTACGCCACCTTCCTCCTCTACTTCATGAGCCCCTCCGTGGATCTCCGGACCAAGCCGGACTTCTCGTGGGCTACTAAAATCGCGCACCAATGGAAGCAGTTCATGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782471.1
MGMSRNVRSGDYLEGMLSDYMGGKGAKLKVQKSSPSKLVTVLTCLQFAFAVYATFLLYFMSPSVDLRTKPDFSWATKIAHQWKQFMVVSHYQEPNALVRADQLVAPRTSPSEVCEHEQIDFVQKKSNDEVMIKFKRDLYRDVQNFQKQNMGTETLSELMGMKSKWDLHGPNIPKVTVILNHFKRKTLCAQLESLLHQTLPFHHVWVLSFGSPNEKSLKRIVESYNNSRISFISSSYDFKYYGRFQMALQTEADLVYILDD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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