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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001001`

染色体: Chr08 坐标: 7527427-7530959 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001001`
名称	SmilChr08G001001
描述	protein CNGC15b-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	7527427 - 7530959 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000544`
GeneID	`131000544`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000544`
原始查询	`LOC131000544`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein CNGC15b-like
产物	protein CNGC15b-like
Arabidopsis	`AT2G28260` (CNGC15) cyclic nucleotide-gated channel 15 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817372] identity=74.2; qcov=0.997; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0627700` (OsCNGC3) - identity=56.2; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005216 (monoatomic ion channel activity); GO:0006811 (monoatomic ion transport); GO:0016020 (membrane); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	smil04626 (Plant-pathogen interaction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00027 (cNMP_binding); PF00520 (Ion_trans)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000544

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057782501.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782501.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782501.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782501.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057782501.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:7528899`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B14,B33,B79,C74
`Chr8:7529111`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B36
`Chr8:7529111`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B36
`Chr8:7529395`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B2,B79,C63,C70
`Chr8:7529757`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B48
`Chr8:7529757`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B48
`Chr8:7529776`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C15,C40
`Chr8:7529810`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B33,B76,C12
`Chr8:7530394`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr8:7530562`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr8:7530610`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B29
`Chr8:7530610`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B29

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782501.1

697 aa

348

697

Ion_trans

cNMP_binding

PF00520 Ion_trans 82-402 aa PF00027 cNMP_binding 498-586 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782501.1`	Pfam	`PF00520`	Ion_trans	Family	82	402	2.4e-18	66.9	Ion transport protein
`XP_057782501.1`	Pfam	`PF00027`	cNMP_binding	Domain	498	586	4e-07	30.6	Cyclic nucleotide-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926518.1
ACAACCTCCCTGCCCTCCACCCCATTCTCAACCTTCTCTAGTCTGGACTCTGGACTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACACACACACACATACATCGTATAATACATTGCCATAAATTTGATTCATTAATTTATTTCAATTTTCCATATTCATGCTGATGCTGTCATCTCCTTCACAAGAAATAATAACTGATGAACTTCTGGGGTGGCAAGAACAACGAGATATGGAGACTATTTCAAAGGCGACAGAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000544
ATGGCTTATACTAATTCAAGATCTGTGAGATTTCATGATGATGTTGAATTTGGGAATTTCAATAGTGACCACTTGTTTAAGGTACACTACAAGATTGATGGAACGCGGGTGGCAGAGTCGAGCTCCAAGAAGGCTGATAAGGGTGGAAGATCACTGAAATCCAAGGTGCTATCGCGTGTCTTCTCAGAGGATTACGAGAGAGTTAAGAAAAGGATCTTGGATCCTCGAGGGCCTGCAATCCGTAGATGGAACAAGATTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782501.1
MAYTNSRSVRFHDDVEFGNFNSDHLFKVHYKIDGTRVAESSSKKADKGGRSLKSKVLSRVFSEDYERVKKRILDPRGPAIRRWNKILLVACLVSLFVDPLFFYLPVVRQNLCIDIGFTLEVVLTIIRSIADAFYAIQIYIRFRTAYVAPSSRVFGRGELVIDSKKIASRYLRSYFWLDAICALPLPQMLIWGIIPSLRGSTMTNTKNVLRFIIIFQYIPRLFLMFPLSSQIVKATGVVTETAWAGAAYNLMLYMLASHVL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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