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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000949`

染色体: Chr08 坐标: 7071809-7075014 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000949`
名称	SmilChr08G000949
描述	uncharacterized SmilChr08G000949
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	7071809 - 7075014 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000571`
GeneID	`131000571`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000571`
原始查询	`LOC131000571`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819415]; symbol=AT2G48030; hit=AT2G48030; species=arabidopsis; confidence=high
产物	DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819415]; symbol=AT2G48030; hit=AT2G48030; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G48030` (AT2G48030) DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819415] identity=61.4; qcov=0.901; evalue=4.83e-167; confidence=high
Rice	`Os07g0645500` - identity=56; qcov=0.905; evalue=8.28e-150; confidence=high
GO	GO:0003824 (catalytic activity); GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0006506 (GPI anchor biosynthetic process)
KEGG	-
Pfam	PF03372 (Exo_endo_phos)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000571

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	0.40000	`XP_057782553.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057782553.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057782553.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057782553.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782553.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:7072737`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B51,C62
`Chr8:7072742`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr8:7074023`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr8:7074051`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B51,C46,C62
`Chr8:7074058`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	17	A23,B1,B123,B132,B18,B53,B69,B78,B79,B90,C41,C53,C87,C9,D10,D2,D8
`Chr8:7074085`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	15	A23,B1,B132,B18,B53,B69,B78,B79,B90,C41,C53,C87,C9,D10,D8
`Chr8:7074148`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	A23,B1,B18,B53,B69,B79,C45,C87
`Chr8:7074154`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr8:7074185`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B36,B67
`Chr8:7074261`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B115,B121,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782553.1

454 aa

227

454

Exo_endo_phos

PF03372 Exo_endo_phos 174-405 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782553.1`	Pfam	`PF03372`	Exo_endo_phos	Domain	174	405	7.5e-10	39.6	Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926570.1
AGTAGTATTTGGCATAAAAATATTGAAATGAAAGACTTTAGCAGATTACAAGTAGTCCACTACGTAGCAAATTACATAATCTAATTAAGGTGTGAAACTGAAAATACAAGCTAATGATTCATCATCAAATTCAAAAAAGGCATTGACCTGCCCAAAAGTCACCTGCCCACTTCATTCAAAGACTGCCAACACATTTTCAACCTCATAAAACTCTCTCTCTCTCTCTCAGGCTCAAAAAAAAAAAAAACTCTCTCTCTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000571
ATGCTCAAGGTATTCAACAAGAAGCTCCGCCGCCTCTGCTCCAGACTGGGGTGGCCCCGCCGCCGCACCCGCCGCTCCCGCCCCAAGATCGTCGTGAAGAAGCTCGGCAAATCGAGCTCCAGAGCTCAGCCGGAATCCGCCGCCGGAATATCGTCGGCCGTGATCTACCCCAGCTCCGAATTAGGCGGCGCGAAGGCGATAAGGTTCGTGTCATTTAATGCTGCCCTCTTCTCCATGGCACCAGCTGTCACCACAGCGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782553.1
MLKVFNKKLRRLCSRLGWPRRRTRRSRPKIVVKKLGKSSSRAQPESAAGISSAVIYPSSELGGAKAIRFVSFNAALFSMAPAVTTAEESSGGEQEPRKGRERNDRPRSILKQSPLHPGSASDDLPSRQQKFARSRLRVSINLPDNEISLKRSGQLSFDKFEELSGESRRPGGGRGRAVAEVLRELNADVVALQDVKAEEEKNMRPLSDLAEALGMKYVFAESWAPEFGNAILSRWPIKRWKAHRIFDDTDFRNVLKATID...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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