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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001024`

染色体: Chr08 坐标: 7786690-7790320 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001024`
名称	SmilChr08G001024
描述	OVARIAN TUMOR DOMAIN-containing deubiquitinating enzyme 12-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	7786690 - 7790320 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000581`
GeneID	`131000581`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000581`
原始查询	`LOC131000581`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OVARIAN TUMOR DOMAIN-containing deubiquitinating enzyme 12-like
产物	OVARIAN TUMOR DOMAIN-containing deubiquitinating enzyme 12-like
Arabidopsis	`AT5G04250` (AT5G04250) Cysteine proteinases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830304] identity=46.8; qcov=1.02; evalue=4.49e-98; confidence=high
Rice	`Os03g0859800` - identity=66.7; qcov=0.617; evalue=5.08e-101; confidence=high
GO	GO:0004843 (cysteine-type deubiquitinase activity); GO:0016579 (protein deubiquitination)
KEGG	-
Pfam	PF02338 (OTU)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000581

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057782567.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057782567.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057782568.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782567.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782567.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:7786782`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B7,B94
`Chr8:7786782`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B7,B94
`Chr8:7786916`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr8:7786929`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,C56
`Chr8:7787110`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,D10
`Chr8:7787231`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B126
`Chr8:7787842`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr8:7788776`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C7
`Chr8:7788824`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,C30,D8
`Chr8:7789081`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B38,B41,B78,C73
`Chr8:7789136`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782567.1

388 aa

194

388

OTU

PF02338 OTU 208-294 aa

XP_057782568.1

355 aa

178

355

OTU

PF02338 OTU 208-294 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782567.1`	Pfam	`PF02338`	OTU	Domain	208	294	5.5e-12	47.0	OTU-like cysteine protease
`XP_057782568.1`	Pfam	`PF02338`	OTU	Domain	208	294	7.1e-11	43.4	OTU-like cysteine protease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926584.1
ATTGAGACCCCAAAACTGAGATTCCAATTCCATTGTCCTATCTCTCTCTCTCCAGACAGCAATTCAATTCACCTCGTGACATGACACCCCACCCCCCGAAATTCACGACATTTTCTCACTCGCCCGAATCAATCCCATTATTTCCACACCTTAAATACTCATCATCAATTCTTCCTCTCCTCTCTCTCAATTCTTCTTGGCCTCTCCTCGTGTGGCATCTCGGCAGCGCGATGTCTATATAAATAGATGATAAGGGACTT...

XM_057926585.1
CCCAAAACTGAGATTCCAATTCCATTGTCCTATCTCTCTCTCTCCAGACAGCAATTCAATTCACCTCGTGACATGACACCCCACCCCCCGAAATTCACGACATTTTCTCACTCGCCCGAATCAATCCCATTATTTCCACACCTTAAATACTCATCATCAATTCTTCCTCTCCTCTCTCTCAATTCTTCTTGGCCTCTCCTCGTGTGGCATCTCGGCAGCGCGATGTCTATATAAATAGATGATAAGGGACTTCATGCTTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131000581
ATGATCACATACAACCAAGATCCTGATGTTATTCGCTGGGGACTTAAGCTCTTTGATGGTGATCCTTATTCTAATTGTGGATATTGTGGTTCCATCCCCCAACATAACGCGGACTGCTATCCGGGGCATTATTTGAAAGGATATCAGTATGAGTCGGACTGCAATTATGCAGGAGACCAAAACCTTAATGTAGACAGCCTTCACGACGAACTATCACAACTTTCAGTGACTGAACCAATCAAGTTGTTCCAAGATGGCAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057782567.1
MITYNQDPDVIRWGLKLFDGDPYSNCGYCGSIPQHNADCYPGHYLKGYQYESDCNYAGDQNLNVDSLHDELSQLSVTEPIKLFQDGMEHQTSFCSQDWFPHSLGNYSYVVDGHDSQHEEETDLGISASCSSPGDELYCEEEWSNSLELMDEHAFDGEVGKRLNQISMASIPHIPKINGEIPSIDEATLDHQRLLDRLLVYELVEFKVQGDGNCQFRALSDQFYRTPEHHKFVREQIVNQLRSFPEIYEGYVPMAYDQYLT...

XP_057782568.1
MITYNQDPDVIRWGLKLFDGDPYSNCGYCGSIPQHNADCYPGHYLKGYQYESDCNYAGDQNLNVDSLHDELSQLSVTEPIKLFQDGMEHQTSFCSQDWFPHSLGNYSYVVDGHDSQHEEETDLGISASCSSPGDELYCEEEWSNSLELMDEHAFDGEVGKRLNQISMASIPHIPKINGEIPSIDEATLDHQRLLDRLLVYELVEFKVQGDGNCQFRALSDQFYRTPEHHKFVREQIVNQLRSFPEIYEGYVPMAYDQYLT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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