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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000955`

染色体: Chr08 坐标: 7113255-7114840 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000955`
名称	SmilChr08G000955
描述	uncharacterized SmilChr08G000955
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	7113255 - 7114840 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000584`
GeneID	`131000584`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000584`
原始查询	`LOC131000584`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	BSD domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838679]; symbol=AT1G03350; hit=AT1G03350; species=arabidopsis; confidence=high
产物	BSD domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838679]; symbol=AT1G03350; hit=AT1G03350; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G03350` (AT1G03350) BSD domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838679] identity=46.1; qcov=0.734; evalue=8.93e-68; confidence=high
Rice	`Os01g0273300` - identity=35.8; qcov=1.06; evalue=3.54e-52; confidence=medium
GO	GO:0005737 (cytoplasm)
KEGG	-
Pfam	PF03909 (BSD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000584

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.40000	`XP_057782572.1`
2	Peroxisome	过氧化物酶体	0.40000	`XP_057782572.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057782572.1`
4	Peroxisome membrane	过氧化物酶体膜	0.20000	`XP_057782572.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782572.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:7113699`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr8:7113768`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C57,D11
`Chr8:7113781`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B128,B30,C71
`Chr8:7113816`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B128,B30,C71
`Chr8:7113837`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr8:7113849`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr8:7113934`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B42,B43,B72
`Chr8:7114331`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C18,D11
`Chr8:7114357`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr8:7114400`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,B101

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782572.1

369 aa

184

369

BSD

PF03909 BSD 165-221 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782572.1`	Pfam	`PF03909`	BSD	Domain	165	221	1.6e-11	44.8	BSD domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926589.1
AAGAAGTATTTCCGACGATTAATTATTTATGAAGTGGGCTTAGAATTTAAGAGTCCAATTAGTTTTGGGCTTGCATCCCAAATCATAAGCTAAAAATAAACAAAGGCACCCGAATTCATCATCTTTAGAGAGAAGAAAAAAAGAAAAAGAAATTGAAGTACAATCTTCAACGTAACTGAATCCTCCAATTGCCATGAATTTCTTCAAATCCATTATAACAGACGATCAGGAAGCTCCGACTTCCGAATCCGACCCGGATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000584
ATGAATTTCTTCAAATCCATTATAACAGACGATCAGGAAGCTCCGACTTCCGAATCCGACCCGGATTCACCCGGCGGAGTGAGCAATCCCAACGACGCCGATGATGCCTGGAGTTTCGGGGGTTTCGTCAGATCTTTCTCGATGCAATCCGAATCCGTGATCGAGGCGTACCGCAGAGATCTCCAGGAATTCGGGTCGGGTCTCAAGAAAGAGACCGAAATTCTCCGGGAGACGGCCAGCCGCGCCGTCAAGGACCTGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782572.1
MNFFKSIITDDQEAPTSESDPDSPGGVSNPNDADDAWSFGGFVRSFSMQSESVIEAYRRDLQEFGSGLKKETEILRETASRAVKDLPASLEAAQGAIDVVLKSTASMINKEALGFSSDGESEMPGTNRSLNSGRYSRFEAQLIAIQSDLNTFCMEPEDAEDYGKWKLGFELGDYEDAIEGLIGENGIMEGIYGKAVPNAVDQDTFWCRYFYRVEKLKQQEKMRASIVKMAISNDDDEDLSWDVDDDDDVASDGKSKGKTE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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