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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001009`

染色体: Chr08 坐标: 7588023-7590917 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001009`
名称	SmilChr08G001009
描述	phenylacetaldehyde reductase-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	7588023 - 7590917 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000591`
GeneID	`131000591`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000591`
原始查询	`LOC131000591`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phenylacetaldehyde reductase-like
产物	phenylacetaldehyde reductase-like
Arabidopsis	`AT5G58490` (AT5G58490) NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835962] identity=75.8; qcov=0.981; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0818200` (OsCCR22) - identity=65.7; qcov=0.991; evalue=5.84e-149; confidence=high
GO	GO:0016616 (oxidoreductase activity, acting on the CH-OH group of donors, NAD or NADP as acceptor)
KEGG	-
Pfam	PF01073 (3Beta_HSD); PF01370 (Epimerase); PF02719 (Polysacc_synt_2); PF05368 (NmrA); PF07993 (NAD_binding_4); PF08659 (KR); PF13460 (NAD_binding_10); PF16363 (GDP_Man_Dehyd)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000591

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057782583.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057782583.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782583.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782583.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782583.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:7588314`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B92
`Chr8:7588314`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B92
`Chr8:7588316`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B92

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782583.1

324 aa

162

324

NmrA

Polysacc_synt_2

Epimerase

3Beta_HSD

GDP_Man_Dehyd

NAD_binding_10

NAD_binding_4

PF05368 NmrA 9-129 aa PF02719 Polysacc_synt_2 9-148 aa PF01370 Epimerase 9-247 aa PF08659 KR 10-136 aa PF01073 3Beta_HSD 11-241 aa PF16363 GDP_Man_Dehyd 12-129 aa PF13460 NAD_binding_10 13-193 aa PF07993 NAD_binding_4 82-216 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782583.1`	Pfam	`PF05368`	NmrA	Family	9	129	2.4e-10	41.2	NmrA-like family
`XP_057782583.1`	Pfam	`PF02719`	Polysacc_synt_2	Family	9	148	1.2e-07	31.9	Polysaccharide biosynthesis protein
`XP_057782583.1`	Pfam	`PF01370`	Epimerase	Family	9	247	1.1e-28	101.0	NAD dependent epimerase/dehydratase family
`XP_057782583.1`	Pfam	`PF08659`	KR	Family	10	136	1e-06	29.5	KR domain
`XP_057782583.1`	Pfam	`PF01073`	3Beta_HSD	Family	11	241	2.4e-22	80.0	3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family
`XP_057782583.1`	Pfam	`PF16363`	GDP_Man_Dehyd	Domain	12	129	1e-16	62.0	GDP-mannose 4,6 dehydratase
`XP_057782583.1`	Pfam	`PF13460`	NAD_binding_10	Domain	13	193	7.3e-13	49.5	NAD(P)H-binding
`XP_057782583.1`	Pfam	`PF07993`	NAD_binding_4	Family	82	216	2.7e-12	47.1	Male sterility protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926600.1
ACAGAGAGCGAAGAGATGAGCGAGAAAGTTGGAGAAGTGGTGTGTCTGACCGGCGGCAGTGGTTACATTGGCGCATGGCTCGTTCAGCTCCTCCTCGGCCGCGGCTACACCGTCCACGCCACCGTCAAAAATCTCCAGGATGAGAGAGAAACAAAGCACTTGCAAGCACTGGAAGGAGCGGAATCGCGCCTCCGCCTCTTCCAAATCGATTTGCTCGATTACGACTCCATCGTCGCCGCCGCGACCGGTGCCGCCGGAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000591
ATGAGCGAGAAAGTTGGAGAAGTGGTGTGTCTGACCGGCGGCAGTGGTTACATTGGCGCATGGCTCGTTCAGCTCCTCCTCGGCCGCGGCTACACCGTCCACGCCACCGTCAAAAATCTCCAGGATGAGAGAGAAACAAAGCACTTGCAAGCACTGGAAGGAGCGGAATCGCGCCTCCGCCTCTTCCAAATCGATTTGCTCGATTACGACTCCATCGTCGCCGCCGCGACCGGTGCCGCCGGAGTGTTCCACTTGGCCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782583.1
MSEKVGEVVCLTGGSGYIGAWLVQLLLGRGYTVHATVKNLQDERETKHLQALEGAESRLRLFQIDLLDYDSIVAAATGAAGVFHLASPCIVDRVEDPQRELLDPAIKGTINVLTAAKKLGVRRVVVTSSVSAIIPSPNWPADKIKNEDCWTDEEYCKQKEVWYPLSKTMAEKAAWKFAEENGLDIVVVNPGTVMGPIIPPAINASMLMLLRLLQGCTEQYEDFFMGSVHVKDVALAHILVYENPSARGRHVCVEAISHYG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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