当前解析结果
SmilChr08G000995| 统一新 Gene ID | SmilChr08G000995 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G000995 |
| 描述 | alpha carbonic anhydrase 7-like |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 7463647 - 7465546 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131000600 |
|---|---|
| GeneID | 131000600 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131000600 |
| 原始查询 | LOC131000600 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | alpha carbonic anhydrase 7-like |
| 产物 | alpha carbonic anhydrase 7-like |
| Arabidopsis | AT1G08080 (ACA7)alpha carbonic anhydrase 7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837326] identity=61.4; qcov=0.896; evalue=2.61e-113; confidence=high |
| Rice | Os08g0470200 (OsalphaCA6)- identity=52; qcov=0.914; evalue=8.7e-101; confidence=high |
| GO | GO:0004089 (carbonate dehydratase activity); GO:0008270 (zinc ion binding) |
| KEGG | smil00910 (Nitrogen metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)) |
| Pfam | PF00194 (Carb_anhydrase) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131000600 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Secreted | 分泌到胞外 | 0.80000 | XP_057782593.1 |
| 2 | Vacuole | 液泡 | 0.40000 | XP_057782593.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057782593.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057782593.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057782593.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:7464690 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B122,C20,C8,D9 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057782593.1PF00194
Carb_anhydrase 40-259 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057782593.1 |
Pfam | PF00194 |
Carb_anhydrase | Domain | 40 | 259 | 1.8e-35 | 123.4 | Eukaryotic-type carbonic anhydrase |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。