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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004239`

染色体: Chr01 坐标: 60712019-60715266 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004239`
名称	SmilChr01G004239
描述	protein NCA1
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	60712019 - 60715266 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000612`
GeneID	`131000612`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000612`
原始查询	`LOC131000612`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein NCA1
产物	protein NCA1
Arabidopsis	`AT3G54360` (AT3G54360) zinc ion binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824603] identity=64.4; qcov=0.997; evalue=7.49e-170; confidence=high
Rice	`Os01g0104100` (OsCOIN) - identity=62.1; qcov=1.01; evalue=5.23e-161; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0016567 (protein ubiquitination); GO:0061630 (ubiquitin protein ligase activity)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000612

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057782611.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057782611.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782611.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782611.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782611.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:60713086`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C50
`Chr1:60713322`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr1:60713406`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B137
`Chr1:60713473`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr1:60713667`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr1:60713680`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B118,D3,D4
`Chr1:60713889`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B11,B69
`Chr1:60713889`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B11,B69
`Chr1:60714160`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,D6
`Chr1:60714186`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr1:60714762`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926637.1
ATAATTCAAGAATTATTACATCAAGAAAAACACTATTGTTATGTAGACTTTTCAAAACGACGAAGTACAACAGGAAAAGGATATTTTCTTTTCCGCATGATTTTTCCTCATCTTAGAAAATTCTCCCTTTTCATTCTTCCCCTTATAGATTCTGATCACAATGACGCCTGTATGCCCTTTTAACAAGGCTTCTCGGCCTGATGATGCATCTGGAAAGAAACCTAGTGAAAACCAGAGTAAACAGCAGGCGTCTAGTGATA...

XM_057926628.1
AAGAATTATTACATCAAGAAAAACACTATTGTTATGTAGACTTTTCAAAACGACGAAGTACAACAGGAAAAGGATATTTTCTTTTCCGCATGATTTTTCCTCATCTTAGAAAATTCTCCCTTTTCATTCTTCCCCTTATAGATTCTGGTAAGTGAGCATTTTGGTTCAGAAAATATACTGGTATATCTATCTGATATCAAAGAAGCTAAGAAAAATCTGGAATTCGAGTAAAATTCAAGAATTTAGATCACAATGACGCC...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131000612
ATGACGCCTGTATGCCCTTTTAACAAGGCTTCTCGGCCTGATGATGCATCTGGAAAGAAACCTAGTGAAAACCAGAGTAAACAGCAGGCGTCTAGTGATAACAAGTTGCAGCAAGATGCAGCGATTTCAGCAAAATGCCCCTTTGATAACAAGTCGCAGCAAAATGCAGTGATTTCACCAAAATGCCCGTTTGGATATGATTCTCAGACATTTAAGTTGGGTCCTCTCAGCTGCATGGTTTGCCAAGCACTTCTTTTTCA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057782611.1
MTPVCPFNKASRPDDASGKKPSENQSKQQASSDNKLQQDAAISAKCPFDNKSQQNAVISPKCPFGYDSQTFKLGPLSCMVCQALLFQCSKCVPCSHVFCKVCISRFSDCPLCGADIEKIEDDPDLQKTVDRFIEGHARIKRSQIDTDKEEREADTKTVIYEDVSFERGDFLMQQAMRALRANNIESAKSRLGVCAEDVREQLQKSGNTPELCSQLGAVLGMLGDCCRTTGDASSAVSYFEESVNFLMKVPKDDLEIIHTL...

XP_057782620.1
MTPVCPFNKASRPDDASGKKPSENQSKQQASSDNKLQQDAAISAKCPFDNKSQQNAVISPKCPFGYDSQTFKLGPLSCMVCQALLFQCSKCVPCSHVFCKVCISRFSDCPLCGADIEKIEDDPDLQKTVDRFIEGHARIKRSQIDTDKEEREADTKTVIYEDVSFERGDFLMQQAMRALRANNIESAKSRLGVCAEDVREQLQKSGNTPELCSQLGAVLGMLGDCCRTTGDASSAVSYFEESVNFLMKVPKDDLEIIHTL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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