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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001116`

染色体: Chr01 坐标: 22800547-22801819 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001116`
名称	SmilChr01G001116
描述	uncharacterized SmilChr01G001116
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	22800547 - 22801819 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000616`
GeneID	`131000616`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000616`
原始查询	`LOC131000616`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0315200` - identity=35.2; qcov=0.366; evalue=1.74e-16; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00098 (zf-CCHC); PF08284 (RVP_2); PF13650 (Asp_protease_2); PF19259 (Ty3_capsid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000616

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057782644.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057782644.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057782644.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057782644.1`
5	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057782644.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变，或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782644.1

396 aa

198

396

Ty3_capsid

zf-CCHC

RVP_2

Asp_protease_2

PF19259 Ty3_capsid 10-141 aa PF00098 zf-CCHC 240-256 aa PF08284 RVP_2 315-387 aa PF13650 Asp_protease_2 336-388 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782644.1`	Pfam	`PF19259`	Ty3_capsid	Domain	10	141	2e-07	31.3	Ty3 transposon capsid-like protein
`XP_057782644.1`	Pfam	`PF00098`	zf-CCHC	Domain	240	256	1e-05	26.1	Zinc knuckle
`XP_057782644.1`	Pfam	`PF08284`	RVP_2	Domain	315	387	4.5e-13	49.9	Retroviral aspartyl protease
`XP_057782644.1`	Pfam	`PF13650`	Asp_protease_2	Domain	336	388	2.4e-06	28.9	Aspartyl protease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926661.1
ATGGAACGAATCTTTCGATTTTTGAGATGCAACGACGCACAACGTCTTATGTGCGTGTCTTACCAGCTGAAAGGAACCGCCGACTATTGGTGGGAAGCAAAGCAGAAAACTATGACCCCGGAGCAGTTAGATGAACTCACTTGGGAGCTTTTTAAGACTGCTCTATGTGAGAAGTTCATACCCAGAAGCTATAGGAAAAAGAAGGAGATGGAGTTTACCACCTTAAAGCAAGGGAATAAAACTGTAGTGGAGTACGATCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000616
ATGGAACGAATCTTTCGATTTTTGAGATGCAACGACGCACAACGTCTTATGTGCGTGTCTTACCAGCTGAAAGGAACCGCCGACTATTGGTGGGAAGCAAAGCAGAAAACTATGACCCCGGAGCAGTTAGATGAACTCACTTGGGAGCTTTTTAAGACTGCTCTATGTGAGAAGTTCATACCCAGAAGCTATAGGAAAAAGAAGGAGATGGAGTTTACCACCTTAAAGCAAGGGAATAAAACTGTAGTGGAGTACGATCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782644.1
MERIFRFLRCNDAQRLMCVSYQLKGTADYWWEAKQKTMTPEQLDELTWELFKTALCEKFIPRSYRKKKEMEFTTLKQGNKTVVEYDRLFCDLARYAPYRVDTDEKMSELFCAGLRQEIRVVLASQTALSYAEALNRALDMELAMQPEKITHTPTPPSAQYTQVSNTPYSNQGQKGKRKWENRGNEGKKPWQGQNVQAPFVKGDKLFYGGPATSHPGHQGIPPCPKCNKLHTGVCRAGNPNCFTCGKPGHYSSQCPNRQQG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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