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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001070`

染色体: Chr08 坐标: 8239637-8242923 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001070`
名称	SmilChr08G001070
描述	uncharacterized SmilChr08G001070
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	8239637 - 8242923 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000655`
GeneID	`131000655`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000655`
原始查询	`LOC131000655`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836179]; symbol=AT5G60580; hit=AT5G60580; species=arabidopsis; confidence=high
产物	RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836179]; symbol=AT5G60580; hit=AT5G60580; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G60580` (AT5G60580) RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836179] identity=57.1; qcov=0.927; evalue=7.04e-161; confidence=high
Rice	`Os06g0677300` (OsRFPV-5) - identity=46.4; qcov=0.936; evalue=7.56e-127; confidence=high
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF12906 (RINGv)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000655

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057782653.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782653.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782653.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782653.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057782653.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:8240125`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A14
`Chr8:8240265`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr8:8241230`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr8:8241521`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C19
`Chr8:8241521`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C19

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782653.1

471 aa

236

471

RINGv

PF12906 RINGv 265-312 aa

XP_057782654.1

471 aa

236

471

RINGv

PF12906 RINGv 265-312 aa

XP_057782655.1

471 aa

236

471

RINGv

PF12906 RINGv 265-312 aa

XP_057782656.1

468 aa

234

468

RINGv

PF12906 RINGv 262-309 aa

XP_057782658.1

468 aa

234

468

RINGv

PF12906 RINGv 262-309 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782653.1`	Pfam	`PF12906`	RINGv	Domain	265	312	3e-11	44.0	RING-variant domain
`XP_057782654.1`	Pfam	`PF12906`	RINGv	Domain	265	312	3e-11	44.0	RING-variant domain
`XP_057782655.1`	Pfam	`PF12906`	RINGv	Domain	265	312	3e-11	44.0	RING-variant domain
`XP_057782656.1`	Pfam	`PF12906`	RINGv	Domain	262	309	2.9e-11	44.0	RING-variant domain
`XP_057782658.1`	Pfam	`PF12906`	RINGv	Domain	262	309	2.9e-11	44.0	RING-variant domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

5 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926675.1
ATATACATATACTATGTGATTAAAAAAAGATTAATAAGATGGACACTACCACGTAAGTGGAGCCACGTGGACACTAATAGTATTTTGAAAAATACTAGCAGTGGAAGTTGTGAAAAGCGAAAGCAGTCTGAGCAGCAGCAGGAAGCCATCGATACCGAGATGATCAGCACCGCTCAACACCAAACCCTCATTCCTGCATGTCAACCACAAATTGCTGTTCCGATCGTCGCTGCTGAGGTGGAAAAGTCTTCAGAAATGAT...

XM_057926671.1
ATATACATATACTATGTGATTAAAAAAAGATTAATAAGATGGACACTACCACGTAAGTGGAGCCACGTGGACACTAATAGTATTTTGAAAAATACTAGCAGTGGAAGTTGTGAAAAGCGAAAGCAGTCTGAGCAGCAGCAGGAAGCCATCGATACCGAGATGATCAGCACCGCTCAACACCAAACCCTCATTCCTGCATGTCAACCACAAATTGCTGTTCCGATCGTCGCTGCTGAGGTGGAAAAGTCTTCAGAAATGAT...

CDS

5 records

下载 CDS FASTA

LOC131000655
ATGATCAGCACCGCTCAACACCAAACCCTCATTCCTGCATGTCAACCACAAATTGCTGTTCCGATCGTCGCTGCTGAGGTGGAAAAGTCTTCAGAAATGATGGAAGAAACATCGCAGGGCAAGCCATGGAGGAAACCAAATCTTTTCTTGGAGATACCTAGCAGAGCAGTCGATGAGTCTCCTCAAGAACTCGTCCAAATAAACATGCCTCCAACCCAAACTCCGACGCCCACTCCCAAAAGAGTGAACTTCCTTCTAAC...

Protein

5 records

下载 Protein FASTA

XP_057782653.1
MISTAQHQTLIPACQPQIAVPIVAAEVEKSSEMMEETSQGKPWRKPNLFLEIPSRAVDESPQELVQINMPPTQTPTPTPKRVNFLLTPDPCDSLLNEASSTRGKPSIRSFMPKLSFKHWGSNSDVDKAANVDSCSSTVATQDKLTISRSWSLTKIFTPRIRRTSSMPVPEVLNQNLESVHGGSVNSHLTVEIKEVRHMSRSLSLPVINKENGIQKLNSFFRVIPSTPKVKDEDSVVAVASTGKDDGNLENDEEGGEDIPE...

XP_057782654.1
MISTAQHQTLIPACQPQIAVPIVAAEVEKSSEMMEETSQGKPWRKPNLFLEIPSRAVDESPQELVQINMPPTQTPTPTPKRVNFLLTPDPCDSLLNEASSTRGKPSIRSFMPKLSFKHWGSNSDVDKAANVDSCSSTVATQDKLTISRSWSLTKIFTPRIRRTSSMPVPEVLNQNLESVHGGSVNSHLTVEIKEVRHMSRSLSLPVINKENGIQKLNSFFRVIPSTPKVKDEDSVVAVASTGKDDGNLENDEEGGEDIPE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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