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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004245`

染色体: Chr01 坐标: 60746457-60747578 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004245`
名称	SmilChr01G004245
描述	putative germin-like protein 2-1
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	60746457 - 60747578 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000660`
GeneID	`131000660`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000660`
原始查询	`LOC131000660`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative germin-like protein 2-1
产物	putative germin-like protein 2-1
Arabidopsis	`AT5G38940` (AT5G38940) RmlC-like cupins superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833886] identity=48; qcov=0.917; evalue=1.7e-55; confidence=high
Rice	`Os02g0491600` (OsGLP2-1) - identity=46.2; qcov=0.972; evalue=7.7e-57; confidence=high
GO	GO:0005618 (cell wall); GO:0030145 (manganese ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00190 (Cupin_1); PF07883 (Cupin_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000660

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057782669.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782669.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782669.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782669.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057782669.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:60746971`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	10	A8,B13,B28,B38,B39,B70,B84,C52,C60,D10
`Chr1:60747022`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	A8,B13,B38,B70,B84
`Chr1:60747022`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	5	A8,B13,B38,B70,B84
`Chr1:60747029`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	30	A3,B105,B106,B109,B118,B122,B137,B22,B30,B31,B34,B67,B71,B75,B81,B85,B95,B97,C1,C15,C20,C24,C25,C34,C37,C70,C72,C73,C81,C82
`Chr1:60747083`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr1:60747109`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B104,C50
`Chr1:60747109`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B104,C50
`Chr1:60747114`	`G`	`GCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	18	A1,A8,B108,B115,B117,B131,B44,B5,B50,B60,B70,C23,C32,C41,C48,C52,C55,C68
`Chr1:60747285`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr1:60747430`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	13	A7,B124,B140,B40,B42,B43,B54,B72,B73,B9,C1,C28,C6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782669.1

218 aa

109

218

Cupin_1

Cupin_2

PF00190 Cupin_1 58-208 aa PF07883 Cupin_2 96-166 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782669.1`	Pfam	`PF00190`	Cupin_1	Domain	58	208	3.8e-36	124.6	Cupin
`XP_057782669.1`	Pfam	`PF07883`	Cupin_2	Domain	96	166	1.7e-09	37.9	Cupin domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926686.1
ATTTTATATTCTATGAAGTGTTTTTTTATTTTAGCCTACCTATATATATATGTCTTATCATTGCACCACTTGAAGTTATTGTAATTTACAGTAGCTATTATCTCATGCTACACTAGCTGAAATAATAGAATTTAAAATTTTATATGCAATAATGCATATAATAAAATTTTAAATTAGTTAATAAGATTGAATTTTTCAGAAGGCAATAATGCATTCTTAGTGGAACAGCTCTATAAAAGGAAATAGGCAGTTTACAACCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000660
ATGGGTTCAAATGCCATTTTATTCATCACATTAGCCCTCATAAATTCGATTTGCATGTCCTTGGCCTTCGACCCTAGTCCCCTGCAAGATTTCTGCGTTGCAGATGCCACAGGAAAAGGAGGATGCAAGGACCCAAACACAGTGACCGCCAATGACTTCTTCTTGGGCGGTCTGGATCGGCCCGCAAACACCTCTTTTAACGAGTACGGCGTTGGCGCTGTGGCTTTCGCGTCCGTAGCCACGGTGCCGGGGTTCAACAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782669.1
MGSNAILFITLALINSICMSLAFDPSPLQDFCVADATGKGGCKDPNTVTANDFFLGGLDRPANTSFNEYGVGAVAFASVATVPGFNTLGITATRGVIAPNGIIPPHSHLRASEVIYVEEGVVEVGFITSYPDYKYYTKILNKGDVFIFPVGLVHTGRNLGRKNCVIFGALNSQNPGFNFIPDAVLAAKPAVNSTYLSKAFKLDEKTIKDLQTKSWFSL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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