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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001078`

染色体: Chr08 坐标: 8296229-8298457 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001078`
名称	SmilChr08G001078
描述	uncharacterized SmilChr08G001078
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	8296229 - 8298457 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000661`
GeneID	`131000661`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000661`
原始查询	`LOC131000661`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Late embryosis abundant (LEA) protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836173]; symbol=AT5G60520; hit=AT5G60520; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Late embryosis abundant (LEA) protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836173]; symbol=AT5G60520; hit=AT5G60520; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G60520` (AT5G60520) Late embryosis abundant (LEA) protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836173] identity=71.1; qcov=0.533; evalue=2.03e-165; confidence=medium
Rice	`Os01g0968300` - identity=41.3; qcov=0.443; evalue=1.52e-62; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF06830 (Root_cap)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000661

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.80000	`XP_057782666.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057782666.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057782666.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782666.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782666.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:8296566`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:8296567`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr8:8296679`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,B61
`Chr8:8296709`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr8:8296796`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B135,B33,C6,C7,D8
`Chr8:8296842`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:8296867`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr8:8296916`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,B14
`Chr8:8296931`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B2,B46,C14,C51
`Chr8:8296943`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr8:8297021`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,D6
`Chr8:8297044`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782666.1

584 aa

292

584

Root_cap

PF06830 Root_cap 513-569 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782666.1`	Pfam	`PF06830`	Root_cap	Family	513	569	2.1e-27	95.8	Root cap

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926683.1
GTAAATACAGAATTGAGAGTAGAGTTGAGAACAATCAAAGGTGGATAAAGAGAGAGGGCTAGCTGTATACGTCCATCTCAACAAGCTAACTCCTCTTGCTTTACCCAAACTTCATGGAGTTATATGGCTTCTCGTAGCTATAAATGCTTGGAAATGATGTGCAGATTGGAGTATCATCTTCTATAACCAAAGTAAACAAACACTTAATTTTGAGTTTGCCATCATAACTTTGTAATTGATGGCTACGAGGAGGCAGTGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000661
ATGGCTACGAGGAGGCAGTGCGTTTTGCTGGCCTTCCTCCTCCTATTGGTCTCCATGGAAGTCAGCACCATTCTCGCCCAAAACAGTGGCAACGGAAATGGGGGAAGCAAGAATGGAAATGCTAATGGCAATGCAAACGCTGGAGGCAGCAACGGCAATGCAGATGGCAACGGGAATGGTGGAGGCAAGAATGGAAATGCTAATGGCAATGGGAATGGTGGAGGTCGCAACGGAAATGCAGACGGGAACGGGAATGATGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782666.1
MATRRQCVLLAFLLLLVSMEVSTILAQNSGNGNGGSKNGNANGNANAGGSNGNADGNGNGGGKNGNANGNGNGGGRNGNADGNGNDGGKNGNANGNGNGGGSNGNADGNGNGGGKNGNANGNGNGGGSNGNANGNSNSGGKNGNANGNGNGAGSSGNANGNGNGGGKNGNANGNGNGAGSNGNANGNGNGGGSNGNANGNGNGGGSNGNANGNGNGGGSNGNGNGNGNGGGSNGNGNGNGNSGGNNGNGNGNGNGNGDSS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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