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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001090`

染色体: Chr08 坐标: 8417381-8418164 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001090`
名称	SmilChr08G001090
描述	protein transport protein Sec61 subunit beta
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	8417381 - 8418164 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000671`
GeneID	`131000671`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000671`
原始查询	`LOC131000671`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein transport protein Sec61 subunit beta
产物	protein transport protein Sec61 subunit beta
Arabidopsis	`AT5G60460` (AT5G60460) Preprotein translocase Sec, Sec61-beta subunit protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28721282] identity=73.2; qcov=1; evalue=2.43e-35; confidence=medium
Rice	`Os11g0104050` - identity=58.3; qcov=1; evalue=7.22e-23; confidence=medium
GO	GO:0005784 (Sec61 translocon complex); GO:0006886 (intracellular protein transport)
KEGG	smil03060 (Protein export - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04145 (Phagocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03911 (Sec61_beta)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000671

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057782676.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.60000	`XP_057782676.1`
3	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057782676.1`
4	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057782676.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782676.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:8417643`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr8:8417666`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B33,B59
`Chr8:8417681`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:8417741`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,B101,C8
`Chr8:8417831`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,C21
`Chr8:8417861`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782676.1

108 aa

108

Sec61_beta

PF03911 Sec61_beta 61-99 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782676.1`	Pfam	`PF03911`	Sec61_beta	Family	61	99	4.9e-18	65.6	Sec61beta family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926693.1
TTTGTTCCCACATTTTCTTATCTCTTTCTTTTTCCATAGATACAATCAAAGACAAGGCAGCCTAAAAGAATTCATTGGTGCTAGTGTAGTGTTAGCCGAAATCAATTCTTTATTAAAATAATAGGCAAGGCAAAGATAAAACCTCAAGATCCCCCCAGTATTGGAATTGGATACCATTTTTCAGTTTGACTGAAGTCGGGGAATTCAATATTTCACATATCAATTAGGTTTGAGTGAATCGGCCATGGCGCGAGGCTCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000671
ATGGCGCGAGGCTCCTCCCAATCGCAAGCTACCGCCTCCGCCTCGTCCACCACCTCCCGCCCCGGCACCATGGCCCCGCGCGGCTCGGCCGCCGCCGCCGCCGGGATGCGTCGCCGGAGGCTAGGAGGCGGTTCCAGCTCCTCCAGCTCATCCGGGGTGGGGGCCGGCGGCGGAGGCGGCGGCAACATGCTCCGGTTCTACACGGACGACTCGCCGGGGCTGAAGATCGGCCCCACCGTGGTTCTTATCATGAGCCTCTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782676.1
MARGSSQSQATASASSTTSRPGTMAPRGSAAAAAGMRRRRLGGGSSSSSSSGVGAGGGGGGNMLRFYTDDSPGLKIGPTVVLIMSLCFIGFVTALHVIGKFYRFKTGS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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