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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001098`

染色体: Chr08 坐标: 8468474-8479404 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001098`
名称	SmilChr08G001098
描述	E3 SUMO-protein ligase SIZ1
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	8468474 - 8479404 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000677`
GeneID	`131000677`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000677`
原始查询	`LOC131000677`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	E3 SUMO-protein ligase SIZ1
产物	E3 SUMO-protein ligase SIZ1
Arabidopsis	`AT5G60410` (SIZ1) DNA-binding protein with MIZ/SP-RING zinc finger, PHD-finger and SAP domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836163] identity=60.8; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0125000` (SIZ1) - identity=51.9; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0016925 (protein sumoylation); GO:0061665 (SUMO ligase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02037 (SAP); PF02891 (zf-MIZ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000677

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057782684.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057782684.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782684.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782684.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057782684.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:8469131`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr8:8469456`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C75,D11
`Chr8:8469653`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr8:8469835`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B14,B2,B46,C14,C51
`Chr8:8470036`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B45,B62
`Chr8:8470244`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr8:8470949`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr8:8472030`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B137
`Chr8:8472093`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B14,B2,B46,C14,C51
`Chr8:8472116`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:8474485`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,C75
`Chr8:8475440`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B132,C21,C46,C6,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782684.1

873 aa

436

873

SAP

zf-MIZ

PF02037 SAP 12-42 aa PF02891 zf-MIZ 359-407 aa

XP_057782685.1

871 aa

436

871

SAP

zf-MIZ

PF02037 SAP 12-42 aa PF02891 zf-MIZ 357-405 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782684.1`	Pfam	`PF02037`	SAP	Domain	12	42	1e-07	32.1	SAP domain
`XP_057782684.1`	Pfam	`PF02891`	zf-MIZ	Domain	359	407	1.4e-19	70.4	MIZ/SP-RING zinc finger
`XP_057782685.1`	Pfam	`PF02037`	SAP	Domain	12	42	1e-07	32.1	SAP domain
`XP_057782685.1`	Pfam	`PF02891`	zf-MIZ	Domain	357	405	1.4e-19	70.4	MIZ/SP-RING zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926701.1
ACGTGGAGAAATTGCCACGAGATTGCTTACGTCAAAACCTATGACTGGAAAAAAAGCAGAAAATGCGTCGACACGTAGAGTCGAGCACAGACAATCGAAACCCGGACGTGTCTGCGGGGAATTAACCGGAGTTGATAAACCGACGATACGTCCGGCAATATGGTAGTTTCTCCTCCCTGCTGGTTCCTGGGGTCAAATGAAAGCACACATTTCATACCATTGTTGGTGTGTGTTTGTGTGTGATAGAGAGAGAGGCGGCG...

XM_057926702.1
GGAGAAATTGCCACGAGATTGCTTACGTCAAAACCTATGACTGGAAAAAAAGCAGAAAATGCGTCGACACGTAGAGTCGAGCACAGACAATCGAAACCCGGACGTGTCTGCGGGGAATTAACCGGAGTTGATAAACCGACGATACGTCCGGCAATATGGTAGTTTCTCCTCCCTGCTGGTTCCTGGGGTCAAATGAAAGCACACATTTCATACCATTGTTGGTGTGTGTTTGTGTGTGATAGAGAGAGAGGCGGCGGAGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131000677
ATGGACTTGGTGGCTAGTTGCAAGGAAAAATTAACATATTTTCGCATAAAAGAGCTCAAGGACGTTCTTAACCAGTTAGGGCTTTCAAAGCAGGGAAAGAAACAGGACCTCGTTGATCGAATATTGACTATTCTCTCTGATGAGCAAGGAATGTGGGCCAAGAAAAATTCCATTGGGAAGGAGGGAGTGGCAAAGCTAGTTGATGACACTTACAGAAAAATGCAGGTTTCTGGGTCAACTGAGTTAGCTTCAAAATCAGA...

LOC131000677
ATGGACTTGGTGGCTAGTTGCAAGGAAAAATTAACATATTTTCGCATAAAAGAGCTCAAGGACGTTCTTAACCAGTTAGGGCTTTCAAAGCAGGGAAAGAAACAGGACCTCGTTGATCGAATATTGACTATTCTCTCTGATGAGCAAGTCTCAGGAATGTGGGCCAAGAAAAATTCCATTGGGAAGGAGGGAGTGGCAAAGCTAGTTGATGACACTTACAGAAAAATGCAGGTTTCTGGGTCAACTGAGTTAGCTTCAAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057782684.1
MDLVASCKEKLTYFRIKELKDVLNQLGLSKQGKKQDLVDRILTILSDEQVSGMWAKKNSIGKEGVAKLVDDTYRKMQVSGSTELASKSEAVSDNSNVKLKEEREDSYQAEKIRCLCGSTLPTDSMIKCEDPRCNVWQHMTCVLIPEKPMDGDLPNPPDIFFCEICRLNRADPFWLTVAHPLLPVKLNITNVPTDGSNPSQSVERTFQLLRSDRDMLSKQEYDIQAWCMLLNDKVTFRMQWPLYADLQINGVPVRAINRPG...

XP_057782685.1
MDLVASCKEKLTYFRIKELKDVLNQLGLSKQGKKQDLVDRILTILSDEQGMWAKKNSIGKEGVAKLVDDTYRKMQVSGSTELASKSEAVSDNSNVKLKEEREDSYQAEKIRCLCGSTLPTDSMIKCEDPRCNVWQHMTCVLIPEKPMDGDLPNPPDIFFCEICRLNRADPFWLTVAHPLLPVKLNITNVPTDGSNPSQSVERTFQLLRSDRDMLSKQEYDIQAWCMLLNDKVTFRMQWPLYADLQINGVPVRAINRPGSQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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