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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004242`

染色体: Chr01 坐标: 60723333-60724258 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004242`
名称	SmilChr01G004242
描述	putative germin-like protein 2-1
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	60723333 - 60724258 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000678`
GeneID	`131000678`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000678`
原始查询	`LOC131000678`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative germin-like protein 2-1
产物	putative germin-like protein 2-1
Arabidopsis	`AT5G39160` (AT5G39160) RmlC-like cupins superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833910] identity=63.1; qcov=0.982; evalue=1.14e-89; confidence=high
Rice	`Os02g0491600` (OsGLP2-1) - identity=67.5; qcov=0.972; evalue=1.59e-102; confidence=high
GO	GO:0005618 (cell wall); GO:0030145 (manganese ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00190 (Cupin_1); PF07883 (Cupin_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000678

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057782691.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782691.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782691.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782691.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057782691.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:60723498`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,D11
`Chr1:60723517`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,B128,C41
`Chr1:60723674`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	14	A1,B1,B113,B123,B132,B14,B65,B85,B98,C27,C4,C49,C63,C65
`Chr1:60723685`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr1:60723701`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:60723754`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	151	A1,A11,A14,A15,A16,A18,A19,A2,A20,A21,A22,A23,A24,A3,A4,A5,A6,A7,A8,A9,B1,B10,B101,B103,B107,B108,B11,B110,B111,B117,B118,B119,B12,B120,B123,B125,B127,B129,B130,B131,B132,B135,B139,B14,B15,B17,B19,B2,B21,B24,B25,B28,B3,B30,B32,B33,B34,B36,B38,B39,B41,B43,B45,B46,B47,B48,B49,B5,B51,B56,B58,B59,B6,B60,B64,B65,B66,B69,B7,B70,B72,B74,B78,B79,B80,B81,B82,B83,B84,B85,B87,B88,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B96,B98,B99,C1,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C18,C19,C20,C21,C24,C27,C29,C3,C33,C35,C37,C38,C4,C45,C49,C5,C57,C59,C6,C60,C61,C63,C65,C69,C7,C72,C76,C77,C79,C80,C82,C83,C84,C87,C9,D1,D11,D2,D3,D4,D5,D7,D9
`Chr1:60723758`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B106,B23,B27,C39
`Chr1:60723767`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	18	B124,B140,B23,B40,B54,B57,B58,B63,B78,C28,C31,C51,C62,C64,C66,C9,D2,D8
`Chr1:60723830`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr1:60723832`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	A11,B14,B20,B40,B55,B73,B86,B9,C44,C54,C84
`Chr1:60723920`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:60723968`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	64	A15,A18,A19,A2,A21,A23,A3,A4,A5,A9,B10,B101,B107,B108,B110,B117,B119,B125,B127,B130,B131,B135,B139,B19,B2,B24,B28,B3,B33,B36,B45,B48,B49,B51,B52,B59,B6,B64,B79,B82,B83,B86,B87,B91,B93,B94,C16,C28,C29,C3,C33,C39,C4,C45,C61,C7,C72,C80,C87,C9,D1,D2,D5,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782691.1

218 aa

109

218

Cupin_1

Cupin_2

PF00190 Cupin_1 63-210 aa PF07883 Cupin_2 99-171 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782691.1`	Pfam	`PF00190`	Cupin_1	Domain	63	210	8.6e-54	181.9	Cupin
`XP_057782691.1`	Pfam	`PF07883`	Cupin_2	Domain	99	171	6.6e-10	39.3	Cupin domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926708.1
GAAACAATAATAGTATCAATTTTGTGATCGAGCTTCTGAATTTGTTGTGCATCAATCATGGCTAACAACGTAGTTTTATTAAGCCTGCTACTGGGAGCCCTGTGTCTTGGCTTCCTGGCATCTGCCTTGGAACCTAGTCCTTTGCAAGATTTTTGTGTAGCTGATGACACTGCCTCAGCAAGAGTGAATGGGCATGTCTGCAAGAACCCTGGATCAGTTGGCGCTGAGGATTTCTCCTTTAGCGGCCTGCATATGCCCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000678
ATGGCTAACAACGTAGTTTTATTAAGCCTGCTACTGGGAGCCCTGTGTCTTGGCTTCCTGGCATCTGCCTTGGAACCTAGTCCTTTGCAAGATTTTTGTGTAGCTGATGACACTGCCTCAGCAAGAGTGAATGGGCATGTCTGCAAGAACCCTGGATCAGTTGGCGCTGAGGATTTCTCCTTTAGCGGCCTGCATATGCCCGGCAACACCTCCAACCCTAACGGCTCGAGGGTGACCTCGGTCACTGTTGCCCAGTTGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782691.1
MANNVVLLSLLLGALCLGFLASALEPSPLQDFCVADDTASARVNGHVCKNPGSVGAEDFSFSGLHMPGNTSNPNGSRVTSVTVAQLPGLNTLGISMVRIDYAPWGINPPHTHPRATEVLTVIEGSLEVGFVTSNPDNSLITKTLQKGDVFVFPIGLVHFQRNVGTKNAVAIAALSSQNPGVITIANAVFGSKPEISSDILAKAFQVELSVVQKLQAKF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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