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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001103`

染色体: Chr08 坐标: 8519631-8522134 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001103`
名称	SmilChr08G001103
描述	elongation factor 1-alpha
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	8519631 - 8522134 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000684`
GeneID	`131000684`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000684`
原始查询	`LOC131000684`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	elongation factor 1-alpha
产物	elongation factor 1-alpha
Arabidopsis	`AT1G07920` (AT1G07920) GTP binding Elongation factor Tu family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837307] identity=96.7; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0177400` (rfa1*) - identity=97.3; qcov=0.993; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003746 (translation elongation factor activity); GO:0003924 (GTPase activity); GO:0005525 (GTP binding); GO:0006412 (translation); GO:0006414 (translational elongation)
KEGG	smil03013 (Nucleocytoplasmic transport - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00009 (GTP_EFTU); PF03143 (GTP_EFTU_D3); PF03144 (GTP_EFTU_D2); PF22594 (GTP-eEF1A_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000684

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057782695.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057782695.1`
3	Melanosome	Melanosome	0.20000	`XP_057782695.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782695.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782695.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:8519947`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B124,B26,C40,D3
`Chr8:8520001`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B127,B34,B80,D4
`Chr8:8520007`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B38
`Chr8:8520129`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr8:8520229`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr8:8520340`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr8:8520343`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C22
`Chr8:8520388`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr8:8520576`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	A18
`Chr8:8520576`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	A18
`Chr8:8520615`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr8:8520694`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B45,B62,C11,C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782695.1

449 aa

224

449

GTP_EFTU

GTP_EFTU_D2

GTP_EFTU_D3

GTP-eEF1A_C

PF00009 GTP_EFTU 5-225 aa PF03144 GTP_EFTU_D2 248-313 aa PF03143 GTP_EFTU_D3 322-429 aa PF22594 GTP-eEF1A_C 327-427 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782695.1`	Pfam	`PF00009`	GTP_EFTU	Domain	5	225	3.3e-59	200.4	Elongation factor Tu GTP binding domain
`XP_057782695.1`	Pfam	`PF03144`	GTP_EFTU_D2	Domain	248	313	4.3e-17	63.0	Elongation factor Tu domain 2
`XP_057782695.1`	Pfam	`PF03143`	GTP_EFTU_D3	Domain	322	429	7.9e-28	97.6	Elongation factor Tu C-terminal domain
`XP_057782695.1`	Pfam	`PF22594`	GTP-eEF1A_C	Domain	327	427	1.9e-37	128.4	GTP-eEF1A C-terminal domain-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926712.1
TGGTAAATTTATATCCCGGGAAATCTCCAATATAAACCCTCGCTTCCATTATAAACCCACAGAACCCTCTATTTCTTCTATTTCTCTTCTCGTTTGTTTCCTGCGGCTAGGGTTTTCAGCAGAGGCTTTATCTCTCTAGCATCTCTGTGTTTAAGCTCTTATTAATCAACAATGGGTAAAGAGAAGACTCACATCAACATTGTGGTCATTGGCCATGTCGACTCTGGAAAGTCGACCACCACCGGTCACTTGATCTACAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000684
ATGGGTAAAGAGAAGACTCACATCAACATTGTGGTCATTGGCCATGTCGACTCTGGAAAGTCGACCACCACCGGTCACTTGATCTACAAGCTTGGTGGTATTGACAAGCGTGTCATTGAGAGGTTCGAGAAAGAAGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCATTCAAGTATGCCTGGGTGCTCGACAAGCTCAAGGCTGAGCGTGAGCGTGGTATCACCATTGATATTGCCTTGTGGAAGTTTGAGACCACCAAGTACTACTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782695.1
MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKLGGIDKRVIERFEKEAAEMNKRSFKYAWVLDKLKAERERGITIDIALWKFETTKYYCTVIDAPGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIIDSTTGGFEAGISKDGQTREHALLAFTLGVKQMICCCNKMDATTPKYSKARYDEIIKEVASYLKKVGYNPDKIPFVPISGFEGDNMIERSTNLDWYKGPTLLEALDQILEPKRPSDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGMI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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