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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001107`

染色体: Chr08 坐标: 8590383-8594571 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001107`
名称	SmilChr08G001107
描述	exonuclease V, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	8590383 - 8594571 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000689`
GeneID	`131000689`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000689`
原始查询	`LOC131000689`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	exonuclease V, chloroplastic
产物	exonuclease V%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT5G60370` (AT5G60370) exonuclease V-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836159] identity=50.1; qcov=0.971; evalue=8.79e-125; confidence=high
Rice	`Os05g0123300` - identity=50.4; qcov=0.903; evalue=5.68e-121; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0036297 (interstrand cross-link repair); GO:0045145 (single-stranded DNA 5'-3' DNA exonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF09810 (Exo5); PF12705 (PDDEXK_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000689

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057782700.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057782700.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057782700.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782700.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782700.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:8590647`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr8:8590830`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr8:8590924`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,B12
`Chr8:8591589`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B45,B62,C11,C69
`Chr8:8591678`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782700.1

411 aa

206

411

Exo5

PDDEXK_1

Exo5

PF09810 Exo5 106-219 aa PF12705 PDDEXK_1 184-386 aa PF09810 Exo5 227-291 aa PF09810 Exo5 319-385 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782700.1`	Pfam	`PF09810`	Exo5	Family	106	219	1e-53	183.9	Exonuclease V - a 5' deoxyribonuclease
`XP_057782700.1`	Pfam	`PF12705`	PDDEXK_1	Domain	184	386	3.7e-06	27.8	PD-(D/E)XK nuclease superfamily
`XP_057782700.1`	Pfam	`PF09810`	Exo5	Family	227	291	1e-53	183.9	Exonuclease V - a 5' deoxyribonuclease
`XP_057782700.1`	Pfam	`PF09810`	Exo5	Family	319	385	1e-53	183.9	Exonuclease V - a 5' deoxyribonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926717.1
CGATCGAGCACACGACTTTCATTAAAATGCCTCCCCTTACCTGAAGAAAATGTGAGTATATAACACGCCATTCCAAAAAATAAAATAAAATCGTTATGTGAGTTGGTAAAGAAAATACCGTTGCTCACAAAATCTTACACATCACACCATCCCGGCATTTACAAAGTTGCCCCCGAACCCTCCGTCGTCGGAGCCGCTGCTCTAACGGCCACCCTCCCGCATAAGCCACAATGACCACCAACTCCTCTTCCTCTCCCACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000689
ATGACCACCAACTCCTCTTCCTCTCCCACCACCACCTCCACCGATTCAGGTGAAAAAACCGCCGAAATCCCCATCGAGATCGTCAGCGAAGAGGAAATGGCTCTCATCGAAGCTGCCCTCGCCGCCGCCGCTATGCCTGCTTCTCACCTCCACAGGAATTCTAAATCAATCCGCTCCTTCTCTCTCCTGTCTAAGCGCGGGCTATCCGCTTGCACGTCCACTGGCCCGCCCGATATAGAGGATTCGGGTCGGGCCTGCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782700.1
MTTNSSSSPTTTSTDSGEKTAEIPIEIVSEEEMALIEAALAAAAMPASHLHRNSKSIRSFSLLSKRGLSACTSTGPPDIEDSGRACGSNSPSSQKNKRNRMLEPFLHRFRKGRGLSVTDLTGTEWCEKQTEFILLFGKPKKTKAMKAGSARHVVLEEEVIKRVKVQVESAEDVWALKFINFIVGTNQLLFDGLTRELPLVGFVEGVWMVGIIDEIRMPVSDSTRFPVLVDTKTRVRATLPGEPQKRNGRFQLMCYKYMWD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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