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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001111`

染色体: Chr08 坐标: 8617860-8621774 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001111`
名称	SmilChr08G001111
描述	ATP synthase subunit d, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	8617860 - 8621774 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000693`
GeneID	`131000693`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000693`
原始查询	`LOC131000693`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ATP synthase subunit d, mitochondrial
产物	ATP synthase subunit d%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT3G52300` (ATPQ) ATP synthase D chain [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824395] identity=83.3; qcov=1; evalue=1.99e-105; confidence=high
Rice	`Os08g0478200` (RMtATPd2) - identity=78.1; qcov=1.01; evalue=3.95e-98; confidence=high
GO	GO:0000274 (GO:0000274); GO:0000276 (GO:0000276); GO:0015078 (proton transmembrane transporter activity); GO:0015986 (proton motive force-driven ATP synthesis)
KEGG	smil00190 (Oxidative phosphorylation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF05873 (Mt_ATP-synt_D)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000693

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057782704.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.60000	`XP_057782704.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	0.60000	`XP_057782704.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782704.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782704.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:8619494`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,C15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782704.1

168 aa

168

Mt_ATP-synt_D

PF05873 Mt_ATP-synt_D 15-166 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782704.1`	Pfam	`PF05873`	Mt_ATP-synt_D	Family	15	166	6.3e-19	69.0	ATP synthase D chain, mitochondrial (ATP5H)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926721.1
CTCATGGGCTAAAAGAATAAATCTGGTGTTAGGAAGGTAAAAAAAGAAATCCAAAATCATAACCCTTGTATTCAAAGCCACCGCACTGCTTGGTCACAAATCCGCACACTGCCGTTCACTCAGTTCATCGATCAATCAGCCGATCAAATCTAGCCAGGAAAAATGAGCGGAGCGGGGAAGAAGGTCGCTGACGTCGCATTCAAGGCCGGGAAGACTATCGATTGGGAGGGGATGGCGAAGCTGCTGGTCTCCGACGAGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000693
ATGAGCGGAGCGGGGAAGAAGGTCGCTGACGTCGCATTCAAGGCCGGGAAGACTATCGATTGGGAGGGGATGGCGAAGCTGCTGGTCTCCGACGAGGCTCGCCGCGAGTTCGCCACTCTCCGCCGCGCCTTCGACGAGGTCAACACCCAGCTCCAGACCAAGTTCAGCCAGGAACCAGAACCCATTGACTGGGAGTACTACAGAAAAGGGATTGGATCTCGCTTGGTCGATATGTATAAGCAAGCCTATGATGAAGTTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782704.1
MSGAGKKVADVAFKAGKTIDWEGMAKLLVSDEARREFATLRRAFDEVNTQLQTKFSQEPEPIDWEYYRKGIGSRLVDMYKQAYDEVKIPQYVDNVTPQYKPKFDALLVELKEAEQMSLKESERLEKEVADVQDLKKRLSTMTADEYFEKHPELRKKFDDEIRNDYWGY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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