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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001134`

染色体: Chr08 坐标: 8911863-8913055 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001134`
名称	SmilChr08G001134
描述	putative WUSCHEL-related homeobox 2
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	8911863 - 8913055 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000717`
GeneID	`131000717`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000717`
原始查询	`LOC131000717`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative WUSCHEL-related homeobox 2
产物	putative WUSCHEL-related homeobox 2
Arabidopsis	`AT2G28610` (PRS) Homeodomain-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817410] identity=75.8; qcov=0.478; evalue=2.65e-34; confidence=medium
Rice	`Os05g0118700` (LSY1) - identity=81.5; qcov=0.471; evalue=8.26e-34; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0099402 (plant organ development)
KEGG	-
Pfam	PF00046 (Homeodomain)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000717

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057782745.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782745.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782745.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057782745.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057782745.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:8911956`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106
`Chr8:8912030`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,C11,C69,D4
`Chr8:8912100`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,C65,D8
`Chr8:8912719`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B13,B56,B68,B96
`Chr8:8912737`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B64,C76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782745.1

138 aa

138

Homeodomain

PF00046 Homeodomain 4-64 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782745.1`	Pfam	`PF00046`	Homeodomain	Domain	4	64	1.8e-13	50.8	Homeodomain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926762.1
CTCATGAAAGCTGAGTAGACATCAGCATGAGACGCTGTCTATTTATACGCTTCATCAACATGAATACACACACAAAATTGAGATAATGATGAGCAACAGAAGATGGTGCCCTACTCCAGAGCAGCTGATGGTGCTGGAGGAGCTCTACAGAAGAGGCCTCCGCAGCCCCAACGCCACCCAGATACAGAAGATCACCGCCCACCTCTCCCTCTACGGCACCATCCAGGGTAAAAGCGTCTTTTACTGGTTCCAGAACCACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000717
ATGATGAGCAACAGAAGATGGTGCCCTACTCCAGAGCAGCTGATGGTGCTGGAGGAGCTCTACAGAAGAGGCCTCCGCAGCCCCAACGCCACCCAGATACAGAAGATCACCGCCCACCTCTCCCTCTACGGCACCATCCAGGGTAAAAGCGTCTTTTACTGGTTCCAGAACCACAAGGCCCGCGACCGCCAGAAACTCCGCCACCACCACTTCTACCAATCCTTCCTTTTTCATCAGGGTAGTAATGGAGTAGTGATGCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782745.1
MMSNRRWCPTPEQLMVLEELYRRGLRSPNATQIQKITAHLSLYGTIQGKSVFYWFQNHKARDRQKLRHHHFYQSFLFHQGSNGVVMRPTWRSPWSVRRNGHDSAMIMEKGPIPTPRSQPLQTLELFPLTPPTAANHPS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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