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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001140`

染色体: Chr08 坐标: 8984938-8988925 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001140`
名称	SmilChr08G001140
描述	protein GAMETOPHYTE DEFECTIVE 1
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	8984938 - 8988925 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000724`
GeneID	`131000724`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000724`
原始查询	`LOC131000724`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein GAMETOPHYTE DEFECTIVE 1
产物	protein GAMETOPHYTE DEFECTIVE 1
Arabidopsis	`AT5G59980` (GAF1) Polymerase/histidinol phosphatase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836120] identity=57.4; qcov=0.499; evalue=1.61e-134; confidence=medium
Rice	`Os12g0175900` - identity=42.5; qcov=0.426; evalue=5.49e-66; confidence=low
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0005655 (nucleolar ribonuclease P complex); GO:0008033 (tRNA processing)
KEGG	smil03008 (Ribosome biogenesis in eukaryotes - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01876 (RNase_P_p30)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000724

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057782749.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057782749.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782749.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782749.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057782749.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:8985806`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C10,D8
`Chr8:8985980`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr8:8986060`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:8986123`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B108
`Chr8:8986193`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B108
`Chr8:8986260`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B109,B24,B53,B61
`Chr8:8986327`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,C78
`Chr8:8986662`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr8:8986677`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr8:8986724`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr8:8986736`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B108
`Chr8:8986820`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,C10,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782749.1

702 aa

351

702

RNase_P_p30

PF01876 RNase_P_p30 3-261 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782749.1`	Pfam	`PF01876`	RNase_P_p30	Domain	3	261	1.1e-51	176.1	RNase P subunit p30

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926766.1
TAAACCTCTGCGGCCCATTAAACCCCCTCTTCTGCCACAAAAAATAAACCTCCCCGCCGCGGCGCCGCCATCGCCAACACCGCAATCTCTTATTCTCACAAATGGGGTTCTTTGACTTGAACATACCCTACCGCGAATCTGACCGCCATGCCATCGACAAACCGTCCCTGAGAGGACGCCGCCTGAAGCTCGCCCTTAAAGCCATGGAGCTCGGCTACACCGGCATCGCTTACAGCCGCACCCTCACAGGCGTCATGTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000724
ATGGGGTTCTTTGACTTGAACATACCCTACCGCGAATCTGACCGCCATGCCATCGACAAACCGTCCCTGAGAGGACGCCGCCTGAAGCTCGCCCTTAAAGCCATGGAGCTCGGCTACACCGGCATCGCTTACAGCCGCACCCTCACAGGCGTCATGTCGGAATCCGATCGCTGCTCCATCGTTCTCTTTCCCATCTCCACACTCTGCCCGTCCTCCTCGTCTTTCTTCGCCTCCGTCAAGCTCCACCGCGACCTTCTGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782749.1
MGFFDLNIPYRESDRHAIDKPSLRGRRLKLALKAMELGYTGIAYSRTLTGVMSESDRCSIVLFPISTLCPSSSSFFASVKLHRDLLNVAVTAPFRQYTRLTVVVTNSAQALALNSGNPILRSYDIVAVRPTRQDAFDQACQTSEVDMISIDFSKMDSFSFRLKQPMVKAAIKRGLYFEITYSDLFADAESKRKMISNCKLLVDWTRGKNLIICSDAASATELRGPQDVANLFFLLGLPRERAKAAISSNCRSLLAKAIRK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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