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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001143`

染色体: Chr08 坐标: 9012937-9015842 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001143`
名称	SmilChr08G001143
描述	receptor-like protein kinase HERK 1
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	9012937 - 9015842 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000728`
GeneID	`131000728`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000728`
原始查询	`LOC131000728`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor-like protein kinase HERK 1
产物	receptor-like protein kinase HERK 1
Arabidopsis	`AT3G46290` (HERK1) hercules receptor kinase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823774] identity=58.8; qcov=0.904; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0334300` (OsCrRLK1L14) - identity=56.8; qcov=0.913; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004714 (transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0009506 (plasmodesma); GO:0046777 (protein autophosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF11721 (Malectin); PF12819 (Malectin_like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000728

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057782752.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782752.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782752.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782752.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057782752.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:9013093`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C76
`Chr8:9013151`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,B64
`Chr8:9013211`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,C11,C69
`Chr8:9013351`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C76
`Chr8:9013352`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C76
`Chr8:9013849`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr8:9013967`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106
`Chr8:9013999`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C19
`Chr8:9014124`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	B10,B129,B28,B79,B99,C10,C76,C85,C87,D11,D8
`Chr8:9014126`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	11	B10,B129,B28,B79,B99,C10,C76,C85,C87,D11,D8
`Chr8:9014162`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B27,B52
`Chr8:9014304`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B137

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782752.1

909 aa

454

909

Malectin

Malectin_like

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF11721 Malectin 131-264 aa PF12819 Malectin_like 132-484 aa PF00069 Pkinase 580-781 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 582-775 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782752.1`	Pfam	`PF11721`	Malectin	Domain	131	264	1.3e-13	52.0	Malectin domain
`XP_057782752.1`	Pfam	`PF12819`	Malectin_like	Domain	132	484	9.6e-29	101.4	Malectin-like domain
`XP_057782752.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	580	781	1.3e-42	146.7	Protein kinase domain
`XP_057782752.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	582	775	3.6e-47	161.6	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926769.1
TCTGTCCATTTTTAAAGGGAAAAAATAATCTATTCTCATACAGTAAGAAATATGCATGCATCATCATGTATGCGCATGCCAAACTCTGTCACGCATCATGTATCAAGGTATTGTATATGTCACTTTTAAAGGAAAATCTCACTGTAATTTGCATCAAGCTATCTTTTTGTTGTTGAGCGCCACAAACTTTGAAACGTTTGTCCTTTTCCCCTTCATTTGTTTCCTTCTAAAACATTCATTTGGTTTTCTCTCTCTTGAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000728
ATGCATCATCATGTATGCGCATGCCAAACTCTGTCACGCATCATGTATCAAGGTATTGTATATGTCACTTTTAAAGGAAAATCTCACTGTAATTTGCATCAAGCTATCTTTTTGTTGTTGAGCGCCACAAACTTTGAAACGTTTGTCCTTTTCCCCTTCATTTGTTTCCTTCTAAAACATTCATTTGGTTTTCTCTCTCTTGAAGCTAATTATCTCTCCAAGGTGCAAACTTCTCTCTCTCTCTCTCTCACCTTCTGCTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782752.1
MHHHVCACQTLSRIMYQGIVYVTFKGKSHCNLHQAIFLLLSATNFETFVLFPFICFLLKHSFGFLSLEANYLSKVQTSLSLSLTFCYLKGAIFMLYMMMMDCGVLRFSFLQFLILNLACCCIGFHPIDKYYINCGSSTDVAIGSITYIADKSSSRFLSTPRDILAHTNSNSITSSDDSVLFPTARIFTDPSRYTFPISQTGRHWIRLRFYPFLYQNLDMKSASFSVYLWDKKTRLLTDFSPQKATVKEYSLNVTSGNIVI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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