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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001156`

染色体: Chr08 坐标: 9182610-9184755 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001156`
名称	SmilChr08G001156
描述	60S ribosomal protein L35-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	9182610 - 9184755 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000740`
GeneID	`131000740`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000740`
原始查询	`LOC131000740`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	60S ribosomal protein L35-like
产物	60S ribosomal protein L35-like
Arabidopsis	`AT2G39390` (AT2G39390) Ribosomal L29 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818524] identity=90.2; qcov=0.804; evalue=2.07e-73; confidence=high
Rice	`Os04g0376000` - identity=84.4; qcov=0.797; evalue=6.74e-67; confidence=high
GO	GO:0000463 (maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)); GO:0003729 (mRNA binding); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0022625 (cytosolic large ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00831 (Ribosomal_L29)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000740

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057782773.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057782773.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782773.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782773.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782773.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:9184583`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	A20,A22,A25,A7,B53,B71,B75,C19,C65,C70
`Chr8:9184648`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	24	A20,A22,A25,A7,A8,B130,B138,B21,B41,B53,B71,B72,B75,B90,B92,C19,C24,C26,C56,C61,C65,C70,C71,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782773.1

153 aa

153

Ribosomal_L29

PF00831 Ribosomal_L29 38-94 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782773.1`	Pfam	`PF00831`	Ribosomal_L29	Family	38	94	3.6e-17	62.8	Ribosomal L29 protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926790.1
TATATAATTTAGCCCAAACGTATAGCTCTCCTATCAATCTGTAAGCCCAATTATTACAATAATCAAAATAACCCTAAGCCCAAATCCGACATAAATATATGGTTTTACGATTTGGCAGTTTTCTCCCCGTTGCCCGCTCTCCTGCACCAGCAAACCCTAAACCCCAATCCCCTAGAGACGAACGCGAAATGGCGAGAATTAAGGTGCACGAGTTGAGGCAGAAGAGCAAGGTGGATCTGTTGGCGCAGCTGAAGGATTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000740
ATGGTTTTACGATTTGGCAGTTTTCTCCCCGTTGCCCGCTCTCCTGCACCAGCAAACCCTAAACCCCAATCCCCTAGAGACGAACGCGAAATGGCGAGAATTAAGGTGCACGAGTTGAGGCAGAAGAGCAAGGTGGATCTGTTGGCGCAGCTGAAGGATTTGAAGGCGGAGTTGGCGCTGCTGCGGGTGGCGAAGGTGACCGGTGGTGCCCCCAACAAGCTGTCGAAGATCAAGGTTGTGAGGCTGTCTATTGCACAGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782773.1
MVLRFGSFLPVARSPAPANPKPQSPRDEREMARIKVHELRQKSKVDLLAQLKDLKAELALLRVAKVTGGAPNKLSKIKVVRLSIAQVLTVISQKQKTALREAYKNKKYLPLDLRPKKTRAIRRRLTKHQASLKTEKQKKKEMYFPLRKYAIKV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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