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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004248`

染色体: Chr01 坐标: 60783001-60784053 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004248`
名称	SmilChr01G004248
描述	germin-like protein subfamily 1 member 15
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	60783001 - 60784053 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000743`
GeneID	`131000743`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000743`
原始查询	`LOC131000743`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	germin-like protein subfamily 1 member 15
产物	germin-like protein subfamily 1 member 15
Arabidopsis	`AT5G39120` (AT5G39120) RmlC-like cupins superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833905] identity=44.2; qcov=1.02; evalue=3.58e-57; confidence=medium
Rice	`Os02g0491600` (OsGLP2-1) - identity=41.9; qcov=0.995; evalue=4.82e-54; confidence=medium
GO	GO:0005618 (cell wall); GO:0030145 (manganese ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00190 (Cupin_1); PF07883 (Cupin_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000743

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057782787.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782787.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782787.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782787.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057782787.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:60783232`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	B60,B65,B99,C33,C37,C42,C43
`Chr1:60783239`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B11,B60,B99,C37,C42,C43
`Chr1:60783261`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B53,C10,C33,C37
`Chr1:60783263`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B23,B53,B58,C10,C62
`Chr1:60783268`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B82
`Chr1:60783268`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B82
`Chr1:60783271`	`CAG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B82
`Chr1:60783271`	`CAG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B82
`Chr1:60783290`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B51,B53,B82,C10
`Chr1:60783308`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B60,C37,C43
`Chr1:60783334`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B51,B53,B82,C10
`Chr1:60783349`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B51,B53,B82,C10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782787.1

211 aa

106

211

Cupin_1

Cupin_2

PF00190 Cupin_1 54-202 aa PF07883 Cupin_2 89-156 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782787.1`	Pfam	`PF00190`	Cupin_1	Domain	54	202	4.5e-36	124.4	Cupin
`XP_057782787.1`	Pfam	`PF07883`	Cupin_2	Domain	89	156	1.9e-08	34.6	Cupin domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926804.1
AAGCAAGGTTTCTTGATTTGGATTTAGTAACAAATAAAAAAGTTAAGAATTCCAAATGGCTTCAATTGCTATTTTGTTAATCACATTTAATTTCATTTGCACCTCCTTCGCCTTTGACCCTCGTCCTCTTCAAGACTTCTGTGTTGCAGATCCCCCGGGAAACGCAACATGCAAGGATCCAAAAACAGTTACCGCCAACGACTTCTTTTTGAGCGGTCTGGATCGGCCGGGACCCTTTAACGCGTACGGCACCACAGCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000743
ATGGCTTCAATTGCTATTTTGTTAATCACATTTAATTTCATTTGCACCTCCTTCGCCTTTGACCCTCGTCCTCTTCAAGACTTCTGTGTTGCAGATCCCCCGGGAAACGCAACATGCAAGGATCCAAAAACAGTTACCGCCAACGACTTCTTTTTGAGCGGTCTGGATCGGCCGGGACCCTTTAACGCGTACGGCACCACAGCCGTCCGCGCCAAATCGGACACGGTGCCGGGGTTCAACACTCTTGGCCTGACATTTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782787.1
MASIAILLITFNFICTSFAFDPRPLQDFCVADPPGNATCKDPKTVTANDFFLSGLDRPGPFNAYGTTAVRAKSDTVPGFNTLGLTFVRSEYAPNGYLPPHIHPSSSEVIYVVEGMLEVGFITTYPEYKYYSKVLNKGDVFIIPVGLLHTQRNVARTKTVITAASNTQNRRVIYTPDSVFAAKPAINSHYLAGAFKLDEKTIKDLQTKPWFM

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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